RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 MAGEA4P43358 317 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 MXI1P50539 228 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM63BQ5T3F8 832 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 CCNJLQ8IV13 435 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 PALM2Q8IXS6 379 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 ZBED8Q8IZ13 594 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 LENG9Q96B70 501 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 MYOZ2Q9NPC6 264 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 IRAK4Q9NWZ3 460 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 CYP39A1Q9NYL5 469 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 ARMCX1Q9P291 453 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 CAPN9O14815 690 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 KRT4P19013 534 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 KCTD2Q14681 263 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 SCYL2Q6P3W7 929 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 FOXR2Q6PJQ5 311 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 LVRNQ6Q4G3 990 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 C1orf186Q6ZWK4 172 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 CBWD2Q8IUF1 395 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 NDC80O14777 642 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 SLC16A4O15374 487 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 T-ENOLP0DO92 83 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 DYNLT1P63172 113 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 CCNA1P78396 465 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 CDR2Q01850 454 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 MTMR2Q13614 643 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 SPDYCQ5MJ68 293 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 SNX30Q5VWJ9 437 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 NLRP9Q7RTR0 991 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 SPATA24Q86W54 205 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 CFAP61Q8NHU2 1237 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 NVLO15381 856 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 CYP3A4P08684 503 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 SNHG28P0DPA3 235 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.239e-6■□□□□ 8.9
NEDD9-216ENST00000620854 OSBPP22059 807 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 FMO1Q01740 532 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 CXCL9Q07325 125 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 SPARCL1Q14515 664 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 RASIP1Q5U651 963 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 PHC3Q8NDX5 983 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 RSAD2Q8WXG1 361 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 SEMA4DQ92854 862 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 SYT11Q9BT88 431 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 NMRK1Q9NWW6 199 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 GGA3Q9NZ52 723 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 NEU2Q9Y3R4 380 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 ROBO3Q96MS0 1386 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 I3L4J1 428 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 GYG2O15488 501 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 FGFR1P11362 822 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 CYP11B1P15538 503 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 ADRA1DP25100 572 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 ANXA13P27216 316 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 RASSF2P50749 326 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 PEX3P56589 373 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 GPS1Q13098 491 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 KIF22Q14807 665 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 CRY2Q49AN0 593 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 ATL2Q8NHH9 583 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 TTC1Q99614 292 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 C11orf70Q9BRQ4 267 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 LXNQ9BS40 222 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD9-216ENST00000620854 HEY2Q9UBP5 337 aa7.34□□□□□ -1.23
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