RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	SEMA4D	Q92854	862 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	KIF12	Q96FN5	646 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	NT5C1B	Q96P26	610 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	HES2	Q9Y543	173 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ESPN	B1AK53	854 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	EPHB6	O15197	1021 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	LPXN	O60711	386 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	NFIC	P08651	508 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	FAM163B	P0C2L3	166 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC172	P0C7W6	258 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	AKAP5	P24588	427 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	LRPAP1	P30533	357 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	TRPC3	Q13507	836 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	MEA1	Q16626	185 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	DPP3	Q9NY33	737 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ANO9	A1A5B4	782 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	HOXA2	O43364	376 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	DGKI	O75912	1065 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	TH	P07101	528 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PNPLA4	P41247	253 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PIK3CA	P42336	1068 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	JAM2	P57087	298 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	GPM6B	Q13491	265 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	RSAD1	Q9HA92	442 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	SIX4	Q9UIU6	781 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CELF4-222	ENST00000601392	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	TTC28	Q96AY4	2481 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	ARL5C	A6NH57	179 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	PIR	O00625	290 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	PTGES	O14684	152 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	OFD1	O75665	1012 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	PRKCI	P41743	596 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	STAT1	P42224	750 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	MYO1E	Q12965	1108 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	NAB2	Q15742	525 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	IQCE	Q6IPM2	695 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	RRAGA	Q7L523	313 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	TTC39C	Q8N584	583 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	SPAG5	Q96R06	1193 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	EYS	Q5T1H1	3165 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392		A0A0C4DFX4	3053 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	LRRC53	A6NM62	1247 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392		H3BNC9	293 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	ITGB3	P05106	788 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CELF4-222	ENST00000601392	P4HA1	P13674	534 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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