RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601247.5

FCHO1-235, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 458 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-235ENST00000601247 TTC39CQ8N584 583 aa16.39■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 GANQ9H2C0 597 aa16.39■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.39■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 VRTNQ9H8Y1 702 aa16.39■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 FBXL5Q9UKA1 691 aa16.39■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 SNX9Q9Y5X1 595 aa16.39■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 PPEF2O14830 753 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 DDHD2O94830 711 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 CCDC172P0C7W6 258 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 LAG3P18627 525 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 CASP14P31944 242 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 USP8P40818 1118 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 STAT1P42224 750 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 ZBED6P86452 979 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 DSC1Q08554 894 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 UPP1Q16831 310 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 GJB7Q6PEY0 223 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 COLGALT2Q8IYK4 626 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 TATDN2Q93075 761 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 JAKMIP2Q96AA8 810 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF558Q96NG5 402 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 RAD9AQ99638 391 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 STK33Q9BYT3 514 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 XYLT2Q9H1B5 865 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 CYP3A43Q9HB55 503 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 SIX2Q9NPC8 291 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 CAPN11Q9UMQ6 739 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 FHOD1Q9Y613 1164 aa16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 TTC3P53804 2025 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 GYPCP04921 128 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 ODC1P11926 461 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 KRT5P13647 590 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 KRT9P35527 623 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 LILRA4P59901 499 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 APBA1Q02410 837 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 METTL23Q86XA0 190 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 APPL2Q8NEU8 664 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 CXorf38Q8TB03 319 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 RABGGTAQ92696 567 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 SNX25Q9H3E2 840 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 DNAJB4Q9UDY4 337 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 MYO6Q9UM54 1294 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 POLIQ9UNA4 740 aa16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 H0YGN5 161 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 CYB561D2O14569 222 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 NRP1O14786 923 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 MFAP3LO75121 409 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 LRRN2O75325 713 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 NOL4O94818 638 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 CD58P19256 250 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 SLC11A1P49279 550 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 BCAR1P56945 870 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 ASIC2Q16515 512 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 SFMBT2Q5VUG0 894 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM130Q8N3G9 435 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 HASPINQ8TF76 798 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 ELMO3Q96BJ8 720 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 SENP8Q96LD8 212 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 GDAP2Q9NXN4 497 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 CACNG4Q9UBN1 327 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 DSEQ9UL01 958 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 LRRC53A6NM62 1247 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 EPHB6O15197 1021 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 KIF4AO95239 1232 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 FERP16591 822 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 PPM1AP35813 382 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 ADKP55263 362 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 SHHQ15465 462 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 C9orf50Q5SZB4 431 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 PDXDC1Q6P996 788 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 DPH6Q7L8W6 267 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 CCDC186Q7Z3E2 898 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 OR8K1Q8NGG5 319 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 PDLIM2Q96JY6 352 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 PAAF1Q9BRP4 392 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 RWDD3Q9Y3V2 267 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 44.6
FCHO1-235ENST00000601247 F8VZ95 297 aa16.34■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 GALTP07902 379 aa16.34■□□□□ 0.21
FCHO1-235ENST00000601247 WEE2P0C1S8 567 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms