RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	TCHH	Q07283	1943 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRRG1	O14668	218 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPP1R37	O75864	691 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	NFIC	P08651	508 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	AMPD3	Q01432	767 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	TDG	Q13569	410 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPATA1	Q5VX52	437 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF280D	Q6N043	979 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	USP37	Q86T82	979 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	WDR27	A2RRH5	827 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPEF2	O14830	753 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRG1	P02750	347 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADRB2	P07550	413 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	CPB1	P15086	417 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADSS	P30520	456 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ASIC1	P78348	528 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ALCAM	Q13740	583 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	E2F4	Q16254	413 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	RMDN1	Q96DB5	314 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	SAAL1	Q96ER3	474 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ASB7	Q9H672	318 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	SCN1A	P35498	2009 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989		M0QZQ0	153 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	TBC1D4	O60343	1298 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ABLIM3	O94929	683 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	PAPLN	O95428	1278 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	LAMP2	P13473	410 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	HOXA9	P31269	272 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADCY1	Q08828	1119 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	DPP3	Q9NY33	737 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	DERA	Q9Y315	318 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NEDD4L-233	ENST00000591989	NOTCH4	Q99466	2003 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	PIR	O00625	290 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	IL18RAP	O95256	599 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	SEC24A	O95486	1093 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR4Q2	P0C623	313 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATF2	P15336	505 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	PTPN2	P17706	415 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	CASP1	P29466	404 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	AFM	P43652	599 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	LILRA4	P59901	499 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	RTL10	Q7L3V2	364 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	ITFG1	Q8TB96	612 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	ING5	Q8WYH8	240 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	SENP8	Q96LD8	212 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NEDD4L-233	ENST00000591989	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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