RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587721.1

RDH13-209, Transcript of retinol dehydrogenase 13, humanhuman

TSL 4

Gene RDH13, Length 731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13-209ENST00000587721 OR6C75A6NL08 312 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 ZNF263O14978 683 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 FAM13AO94988 1023 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 SDHBP21912 280 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 GDI1P31150 447 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 ALDH1A3P47895 512 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 EPHA5P54756 1037 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 NRLP54845 237 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 NCKAP1LP55160 1127 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 GRM2Q14416 872 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 CD302Q8IX05 232 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 YAF2Q8IY57 180 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 KCNN1Q92952 543 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 CEP72Q9P209 647 aa14.95□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 BMP15O95972 392 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 FCARP24071 287 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 CCR2P41597 374 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 SPAG1Q07617 926 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 GPR17Q13304 367 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 ZBTB6Q15916 424 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 MYCT1Q8N699 235 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 ZBTB44Q8NCP5 570 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 BEST2Q8NFU1 509 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 FAM3CQ92520 227 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 RMDN1Q96DB5 314 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 MSANTD3Q96H12 275 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 PARVGQ9HBI0 331 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 TBX20Q9UMR3 447 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 YIPF1Q9Y548 306 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.94□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 K7ENM7 598 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 OGTO15294 1046 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 TRAK2O60296 914 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 FGF19O95750 216 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 ODC1P11926 461 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 TYMPP19971 482 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 GJB2P29033 226 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 MCM2P49736 904 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 DUSP4Q13115 394 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 MYBPC2Q14324 1141 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 TEAD2Q15562 447 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 OVOS1Q6IE37 1185 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 VITQ6UXI7 678 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 ITIH5Q86UX2 942 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 GPBP1Q86WP2 473 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 DCLK2Q8N568 766 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 FAM212AQ96EL1 285 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 TMX3Q96JJ7 454 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 REEP2Q9BRK0 252 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 ASB3Q9Y575 518 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.93□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 LACTBL1A8MY62 500 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 GJA1P17302 382 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 TNFSF9P41273 254 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 VIPR2P41587 438 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 CCR3P51677 355 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 MTAPQ13126 283 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 ARSHQ5FYA8 562 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 EPC1Q9H2F5 836 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 CHRDQ9H2X0 955 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 DSEQ9UL01 958 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 RAB23Q9ULC3 237 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RDH13-209ENST00000587721 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms