RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584216.5

COPS3-218, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene COPS3, Length 876 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COPS3-218ENST00000584216 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 RAB34Q9BZG1 259 aa14.58□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 C17orf75Q9HAS0 396 aa14.58□□□□□ -0.08
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COPS3-218ENST00000584216 TOM1L1O75674 476 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 RPP40O75818 363 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 AKAP3O75969 853 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 EPN2O95208 641 aa14.56□□□□□ -0.08
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COPS3-218ENST00000584216 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 PON2Q15165 354 aa14.56□□□□□ -0.08
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COPS3-218ENST00000584216 NECAB1Q8N987 351 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
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COPS3-218ENST00000584216 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.56□□□□□ -0.08
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COPS3-218ENST00000584216 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 DNM3Q9UQ16 869 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 NCANO14594 1321 aa14.56□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.55□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 PAX3P23760 479 aa14.55□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 WEE1P30291 646 aa14.55□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 FOSBP53539 338 aa14.55□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 AMPD2Q01433 879 aa14.55□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 DUSP4Q13115 394 aa14.55□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 MYBPC2Q14324 1141 aa14.55□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 STPG1Q5TH74 334 aa14.55□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.55□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.55□□□□□ -0.08
COPS3-218ENST00000584216 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.55□□□□□ -0.08
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