RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583841.1

TSPOAP1-AS1-210, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1-AS1, Length 840 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GCNT4Q9P109 453 aa16.88■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.88■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MYO9BQ13459 2157 aa16.88■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CARNS1A5YM72 827 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PMM2O15305 246 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FGF18O76093 207 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ASS1P00966 412 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ERVK-21P61565 698 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PLCB2Q00722 1185 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UBXN1Q04323 297 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TIGD5Q53EQ6 642 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DSTYKQ6XUX3 929 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GBP6Q6ZN66 633 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCDC150Q8NCX0 1101 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SAMD11Q96NU1 681 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IFNKQ9P0W0 207 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CDH23Q9H251 3354 aa16.87■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 A0A1B0GTH6 734 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KPNA7A9QM74 516 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TEX33O43247 280 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ATICP31939 592 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UBASH3AP57075 661 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TNNC1P63316 161 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NOP14P78316 857 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LRMPQ12912 555 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PTPN21Q16825 1174 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EXOC3L4Q17RC7 722 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 WDR72Q3MJ13 1102 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 WDR44Q5JSH3 913 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FUT10Q6P4F1 479 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARNTL2Q8WYA1 636 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TAF4BQ92750 862 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PLVAPQ9BX97 442 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 VN1R3Q9BXE9 311 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GPR62Q9BZJ7 368 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 POLIQ9UNA4 740 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SNX9Q9Y5X1 595 aa16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C5orf67F2Z3F1 127 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TRAPPC3O43617 180 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLC9A1P19634 815 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF667Q5HYK9 610 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EHBP1Q8NDI1 1231 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LMO3Q8TAP4 145 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 B3GALT6Q96L58 329 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SENP8Q96LD8 212 aa16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CYB561D2O14569 222 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CSPG5O95196 566 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RB1P06400 928 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PON1P27169 355 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KLK7P49862 253 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 APBA1Q02410 837 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KRT17Q04695 432 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KCNMA1Q12791 1236 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NR1I3Q14994 352 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SYCP1Q15431 976 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FAM171A1Q5VUB5 890 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TRIM65Q6PJ69 517 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TAS1R1Q7RTX1 841 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CEP57Q86XR8 500 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TATDN2Q93075 761 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SUSD3Q96L08 255 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NT5C1BQ96P26 610 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MMS19Q96T76 1030 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 VRTNQ9H8Y1 702 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GDAP2Q9NXN4 497 aa16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 M0QZQ0 153 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AP5Z1O43299 807 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EFEMP2O95967 443 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ODC1P11926 461 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PAX3P23760 479 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TKTP29401 623 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RAP1GAPP47736 663 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PLCB3Q01970 1234 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GPM6BQ13491 265 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARHGEF19Q8IW93 802 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 VPS52Q8N1B4 723 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LRCH3Q96II8 777 aa16.83■□□□□ 0.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NIF3L1Q9GZT8 377 aa16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms