RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 GIMAP4Q9NUV9 329 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.171e-6■■■□□ 16.9
PTPRM-211ENST00000580170 TLR2O60603 784 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ADCK1Q86TW2 530 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 SH3GL2Q99962 352 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC78A2IDD5 438 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PSMD3O43242 534 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 HMGCS2P54868 508 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 C16orf89Q6UX73 402 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 NUP93Q8N1F7 819 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PJA2O43164 708 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 RBP5P82980 135 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 USP10Q14694 798 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PPCSQ9HAB8 311 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 STILQ15468 1287 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TTC30AQ86WT1 665 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TASP1Q9H6P5 420 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ASB14A6NK59 587 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 AKAP10O43572 662 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 KDM4CQ9H3R0 1056 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TFR2Q9UP52 801 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 WEE2P0C1S8 567 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 LVRNQ6Q4G3 990 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 KIF2BQ8N4N8 673 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF555Q8NEP9 628 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 HMOX2P30519 316 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.172e-6■■□□□ 12.9
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 KYNUQ16719 465 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ERP44Q9BS26 406 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 THTPAQ9BU02 230 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 E2F8A0AVK6 867 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 MYL2P10916 166 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PTPRN2Q92932 1015 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHGB4Q9UN71 923 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFB10O96000 172 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 NFIXQ14938 502 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 KRT72Q14CN4 511 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 DPYSL4O14531 572 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 IRAK1P51617 712 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 SEC24CP53992 1094 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 EMC2Q15006 297 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 CD248Q9HCU0 757 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ALG6Q9Y672 507 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 SRP72O76094 671 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 KLRC1P26715 233 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 CENPCQ03188 943 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PPP4R4Q6NUP7 873 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TSPAN17Q96FV3 270 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 COPB2P35606 906 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 KCNK16Q96T55 309 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 CDYLQ9Y232 598 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 PTGISQ16647 500 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 GJB7Q6PEY0 223 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 BARGINQ6ZT62 677 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 MED15Q96RN5 788 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0G2JLW4 131 aa22.34■■□□□ 1.17
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