RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	LRRC3	Q9BY71	257 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	GPR88	Q9GZN0	384 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ASAH2	Q9NR71	780 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	CNTN3	Q9P232	1028 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	CHAD	O15335	359 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	JAK2	O60674	1132 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	MCF2	P10911	925 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	PROZ	P22891	400 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	NPTX2	P47972	431 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	PEX3	P56589	373 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	ANAPC15	P60006	121 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	TEAD2	Q15562	447 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF174	Q15697	407 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	WDR44	Q5JSH3	913 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	LONP2	Q86WA8	852 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	APPL2	Q8NEU8	664 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	BEST2	Q8NFU1	509 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	DDX12P	Q92771	950 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	SCN1A	P35498	2009 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	TCHH	Q07283	1943 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	NUP205	Q92621	2012 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC169	A6NNP5	214 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	VNN2	O95498	520 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	HOXA6	P31267	233 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	MCM4	P33991	863 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	LRRC32	Q14392	662 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	DAW1	Q8N136	415 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	TCHP	Q9BT92	498 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	YIPF1	Q9Y548	306 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	OBSL1	O75147	1896 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169		M0QZQ0	153 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	GDF9	O60383	454 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	GABBR2	O75899	941 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	OAZ2	O95190	189 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	CPB1	P15086	417 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	CTH	P32929	405 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	SOX9	P48436	509 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	CLCN6	P51797	869 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	MAPK7	Q13164	816 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169		Q6ZS52	159 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	TMC8	Q8IU68	726 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	YAF2	Q8IY57	180 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	TSC2	P49815	1807 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169		A0A1W2PRU2	124 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	HIP1R	O75146	1068 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	LIMK1	P53667	647 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	GUCY1B3	Q02153	619 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	ST3GAL1	Q11201	340 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	PLD1	Q13393	1074 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	PDIA5	Q14554	519 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	TTC38	Q5R3I4	469 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TCF4-238	ENST00000568169	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		12.42	□□□□□ -0.42

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