RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561431.1

LRRC28-222, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 3

Gene LRRC28, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-222	ENST00000561431	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	KAT5	Q92993	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	MVB12A	Q96EY5	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	LDAH	Q9H6V9	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	ATRN	O75882	1429 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	GLI3	P10071	1580 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	PIK3C2A	O00443	1686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431		A0A1W2PRX2	142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	NOBOX	O60393	691 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	CDC14B	O60729	498 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	CAND2	O75155	1236 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	ITGA10	O75578	1167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	GAST	P01350	101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	SLPI	P03973	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	MYB	P10242	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF20	P17024	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	COPB2	P35606	906 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	CASR	P41180	1078 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	TBR1	Q16650	682 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	SSH2	Q76I76	1423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	LMF1	Q96S06	567 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	AKAP12	Q02952	1782 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	USP6	P35125	1406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	ANP32C	O43423	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC26A4	O43511	780 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	B4GALT3	O60512	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	C6	P13671	934 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	CRHR1	P34998	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	WAS	P42768	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	ADCY7	P51828	1080 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	PPP2CB	P62714	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	PPP2CA	P67775	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	SURF1	Q15526	300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	MRI	Q9BWK5	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	IPP	Q9Y573	584 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	USP54	Q70EL1	1684 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	ACE	P12821	1306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	SLIT3	O75094	1523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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