RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	IGKV2-30	P06310	120 aa		5.12	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	PPP3CB	P16298	524 aa		5.12	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		5.12	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		5.12	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		5.12	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	VTA1	Q9NP79	307 aa		5.12	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	DNM3	Q9UQ16	869 aa		5.12	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		5.12	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		5.12	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	WDR27	A2RRH5	827 aa		5.11	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	SLC5A3	P53794	718 aa		5.11	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	MC2R	Q01718	297 aa		5.11	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF844	Q08AG5	666 aa		5.11	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	STRN3	Q13033	797 aa		5.11	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	DYRK1A	Q13627	763 aa		5.11	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	ETFDH	Q16134	617 aa		5.11	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	ATP2B3	Q16720	1220 aa		5.11	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	RNF180	Q86T96	592 aa		5.11	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	PADI4	Q9UM07	663 aa		5.11	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	VWC2L	B2RUY7	222 aa		5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	SUN1	O94901	812 aa		5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	AGFG2	O95081	481 aa		5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	OSM	P13725	252 aa		5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	KEL	P23276	732 aa		5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	CTXN1	P60606	82 aa		5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	TUBA4A	P68366	448 aa		5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	SNX19	Q92543	992 aa		5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		5.1	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	TRIM38	O00635	465 aa		5.09	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	TOR1B	O14657	336 aa		5.09	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	MTNR1B	P49286	362 aa		5.09	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	5.09	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	ITIH3	Q06033	890 aa		5.09	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		5.09	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	WASF1	Q92558	559 aa		5.09	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		5.09	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	KLC4	Q9NSK0	619 aa		5.09	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		5.09	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		5.09	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF521	Q96K83	1311 aa		5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	LATS1	O95835	1130 aa		5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	TTLL1	O95922	423 aa		5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	SBK3	P0C264	359 aa		5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	GPR3	P46089	330 aa		5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	NXPH1	P58417	271 aa		5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	DPF2	Q92785	391 aa		5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	PBK	Q96KB5	322 aa		5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		5.08	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	GRM6	O15303	877 aa		5.07	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	DRD4	P21917	467 aa		5.07	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	EPHB2	P29323	1055 aa		5.07	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	MORN5	Q5VZ52	161 aa		5.07	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		5.07	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		5.07	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	NEK8	Q86SG6	692 aa		5.07	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	RAB24	Q969Q5	203 aa		5.07	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	RHO	P08100	348 aa		5.06	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	CCT8	P50990	548 aa		5.06	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	GPR162	Q16538	588 aa		5.06	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		5.06	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		5.06	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		5.06	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	UBR7	Q8N806	425 aa		5.06	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		5.06	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	TMX3	Q96JJ7	454 aa		5.06	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		5.06	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	JKAMP	Q9P055	326 aa		5.06	□□□□□ -1.6
COPS2-205	ENST00000558843	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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