RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 BCAT1P54687 386 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 IRX4P78413 519 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 DEUP1Q05D60 604 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 MESDQ14696 234 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC6Q16204 474 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 OLFML2BQ68BL8 750 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 DENND2CQ68D51 928 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 RAPH1Q70E73 1250 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 LRRC8DQ7L1W4 858 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 TTC8Q8TAM2 541 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ADAM2Q99965 735 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 SELENOSQ9BQE4 189 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 NDST4Q9H3R1 872 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 MAN1C1Q9NR34 630 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CEP72Q9P209 647 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 VDRP11473 427 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CCL5P13501 91 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PTPN3P26045 913 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 NPY2RP49146 381 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 C21orf59P57076 290 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 FBXW4P57775 412 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 MTSS1LQ765P7 747 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 C12orf42Q96LP6 360 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 MRGBPQ9NV56 204 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 TLDC2A0PJX2 215 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ESRRBO95718 433 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PYGLP06737 847 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 SULT1E1P49888 294 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 APBA1Q02410 837 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 SYCP2LQ5T4T6 812 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 BSNDQ8WZ55 320 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 TSPAN17Q96FV3 270 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 BRD9Q9H8M2 597 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 AKAP12Q02952 1782 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 MEI4A8MW99 385 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 DNAJC6O75061 913 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PPP3CCP48454 512 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 BCAR1P56945 870 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 NR5A1Q13285 461 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PNOCQ13519 176 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 KLHL35Q6PF15 583 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ANKS1AQ92625 1134 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 RASGRF2O14827 1237 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 AKT1P31749 480 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 NUP85Q9BW27 656 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 POTEMA6NI47 508 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 E9PMD0 336 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 KRIT1O00522 736 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ASS1P00966 412 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 GPC5P78333 572 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PRKAA1Q13131 559 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 UGT3A1Q6NUS8 523 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 C11orf74Q86VG3 221 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 SETD4Q9NVD3 440 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM260Q9NX78 707 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 POTEFA5A3E0 1075 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ACKR2O00590 384 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 APODP05090 189 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 POTEIP0CG38 1075 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CYP2C18P33260 490 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 HALP42357 657 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 THOP1P52888 689 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PDK1Q15118 436 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PGM5Q15124 567 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 ELF2Q15723 593 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 POTEGQ6S5H5 508 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms