RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, human

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STIP1-208	ENST00000540501	MRE11	P49959	708 aa		27.6	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	TNNC1	P63316	161 aa		27.6	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		27.6	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		27.6	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	LINC01553	A4QN01	128 aa		27.59	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	TEX33	O43247	280 aa		27.59	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	BMPR1A	P36894	532 aa		27.59	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	KCNMA1	Q12791	1236 aa		27.59	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	SYCP1	Q15431	976 aa		27.59	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		27.59	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		27.59	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		27.59	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	TTC39C	Q8N584	583 aa		27.59	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	SPATA18	Q8TC71	538 aa		27.59	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	IGSF21	Q96ID5	467 aa		27.59	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	PBX4	Q9BYU1	374 aa		27.59	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		27.59	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	PPEF2	O14830	753 aa		27.58	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	KIF4A	O95239	1232 aa		27.58	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	KRT17	Q04695	432 aa		27.58	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		27.58	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		27.58	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	SUSD3	Q96L08	255 aa		27.58	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	NUP58	Q9BVL2	599 aa		27.58	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		27.58	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		27.58	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	HCST	Q9UBK5	93 aa		27.58	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		27.58	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	DSE	Q9UL01	958 aa		27.58	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		27.58	■■■□□ 2.01
STIP1-208	ENST00000540501	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	27.58	■■■□□ 2.01	7e-6	■■■■■ 86.2
STIP1-208	ENST00000540501	LCHN	A4D1U4	455 aa		27.57	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	HUS1	O60921	280 aa		27.57	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	CA3	P07451	260 aa		27.57	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	SLC9A1	P19634	815 aa		27.57	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	GCNT1	Q02742	428 aa		27.57	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		27.57	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		27.57	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		27.57	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	NEK11	Q8NG66	645 aa		27.57	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		27.57	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	SENP8	Q96LD8	212 aa		27.57	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		27.57	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	MARCH5	Q9NX47	278 aa		27.57	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		27.57	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		27.57	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		27.56	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501		M0QZQ0	153 aa		27.56	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	SYN3	O14994	580 aa		27.56	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	LINC00271	P0C7V0	271 aa		27.56	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	ODC1	P11926	461 aa		27.56	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	PLCB3	Q01970	1234 aa		27.56	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	FUT10	Q6P4F1	479 aa		27.56	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		27.56	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		27.56	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		27.56	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	27.56	■■■□□ 2	2e-9	■□□□□ 11.3
STIP1-208	ENST00000540501	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	CYB561D2	O14569	222 aa		27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	TYMP	P19971	482 aa		27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	CTNNB1	P35222	781 aa		27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	PBX1	P40424	430 aa		27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	ERVK-21	P61565	698 aa		27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	APPL2	Q8NEU8	664 aa		27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	MMS19	Q96T76	1030 aa		27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	LZTS1	Q9Y250	596 aa		27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		27.55	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	ZNF75D	P51815	510 aa		27.54	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	MFAP3	P55082	362 aa		27.54	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	UBE3A	Q05086	875 aa		27.54	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	FIGN	Q5HY92	759 aa		27.54	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		27.54	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	METTL23	Q86XA0	190 aa		27.54	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		27.54	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		27.54	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	RABGGTA	Q92696	567 aa		27.54	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	SPTLC1	O15269	473 aa		27.53	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	TACC1	O75410	805 aa		27.53	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	FGF18	O76093	207 aa		27.53	■■■□□ 2
STIP1-208	ENST00000540501	CYP11A1	P05108	521 aa		27.53	■■■□□ 2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms