RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530528.1

MKNK1-223, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1, human

TSL 2

Gene MKNK1, Length 553 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKNK1-223	ENST00000530528	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	TWF1	Q12792	350 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	PTPA	Q15257	358 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	KYAT1	Q16773	422 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	JADE1	Q6IE81	842 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	SHD	Q96IW2	340 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	GDE1	Q9NZC3	331 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		18.8	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	ECI2	O75521	394 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	ADRB2	P07550	413 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	NFIC	P08651	508 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	CD72	P21854	359 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	18.79	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	GTF2B	Q00403	316 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	REST	Q13127	1097 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	DYM	Q7RTS9	669 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	ELMOD1	Q8N336	334 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	CLIC6	Q96NY7	704 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	ZNF197	O14709	1029 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	MOSPD3	O75425	235 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	OAZ2	O95190	189 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	MYL4	P12829	197 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	GJA1	P17302	382 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	FCAR	P24071	287 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	DDIT3	P35638	169 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	ACOT2	P49753	483 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	PFKP	Q01813	784 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	GRM2	Q14416	872 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	SPATA1	Q5VX52	437 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	USP37	Q86T82	979 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	SFR1	Q86XK3	245 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	BEST2	Q8NFU1	509 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	YIPF1	Q9Y548	306 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528		R4GN57	208 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	SPTLC1	O15269	473 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	PDC	P20941	246 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	SCP2	P22307	547 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	PRKCQ	Q04759	706 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	IQCE	Q6IPM2	695 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	SENP8	Q96LD8	212 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	TMEM209	Q96SK2	561 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MKNK1-223	ENST00000530528	FAM170B	A6NMN3	283 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	SYT1	P21579	422 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	CDR1	P51861	262 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	LILRA4	P59901	499 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	DUSP4	Q13115	394 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	ADAL	Q6DHV7	355 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	CD302	Q8IX05	232 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	ADSSL1	Q8N142	457 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	ASB16	Q96NS5	453 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	ASAH2	Q9NR71	780 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	MAFF	Q9ULX9	164 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	COL4A2	P08572	1712 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	MYMK	A6NI61	221 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	OR6C75	A6NL08	312 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	SP9	P0CG40	484 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	TYMP	P19971	482 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	TEAD2	Q15562	447 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MKNK1-223	ENST00000530528	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		18.75	■□□□□ 0.59

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