RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524955.1

CHMP4A-202, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 2

Gene CHMP4A, Length 268 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-202ENST00000524955 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 ANO10Q9NW15 660 aa4.96□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 FANCLQ9NW38 375 aa4.96□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 TAB2Q9NYJ8 693 aa4.96□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 L1RE1Q9UN81 338 aa4.96□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 RWDD3Q9Y3V2 267 aa4.96□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 C2CD2Q9Y426 696 aa4.96□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 SNX9Q9Y5X1 595 aa4.96□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 TTC3P53804 2025 aa4.96□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 LAMA3Q16787 3333 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 TMEM265A0A087WTH1 108 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 SPDYE4A6NLX3 237 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 KPNA7A9QM74 516 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 KCNJ18B7U540 433 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 XPOTO43592 962 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 ATP2C2O75185 946 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 SOAT2O75908 522 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 GLP2RO95838 553 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 EFEMP2O95967 443 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 CTSAP10619 480 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 ATP1A3P13637 1013 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 CD58P19256 250 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 CYP3A5P20815 502 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 FGFR3P22607 806 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 SP100P23497 879 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 LMO2P25791 158 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 LRPAP1P30533 357 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 RPL9P32969 192 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 OR1D2P34982 312 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 TAF6P49848 677 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 MYL7Q01449 175 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 DSG1Q02413 1049 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 TRPC3Q13507 836 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 NCOA4Q13772 614 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 KCNJ12Q14500 433 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 SURF1Q15526 300 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 PSMD5Q16401 504 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 NFIL3Q16649 462 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 PTPROQ16827 1216 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 ZNF699Q32M78 642 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 USP41Q3LFD5 358 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 SV2CQ496J9 727 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 ZNF394Q53GI3 561 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 KIAA0319Q5VV43 1072 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 GJB7Q6PEY0 223 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 LUZP1Q86V48 1076 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 PDCL2Q8N4E4 241 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 TTC9BQ8N6N2 239 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 RNF214Q8ND24 703 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 OR10T2Q8NGX3 314 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 SLC35C1Q96A29 364 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 SUSD3Q96L08 255 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 ARID3AQ99856 593 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 RTP3Q9BQQ7 232 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 CRACR2AQ9BSW2 395 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 FUCA2Q9BTY2 467 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 XYLT2Q9H1B5 865 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 VPS16Q9H269 839 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 SMYD3Q9H7B4 428 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 TMLHEQ9NVH6 421 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 CLDND1Q9NY35 253 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 ITGA11Q9UKX5 1188 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 PCDHB8Q9UN66 801 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 DERAQ9Y315 318 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 NME7Q9Y5B8 376 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 CDY1Q9Y6F8 540 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 KIAA1671Q9BY89 1806 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 MYH11P35749 1972 aa4.95□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 CHD7Q9P2D1 2997 aa4.94□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 CEP290O15078 2479 aa4.94□□□□□ -1.62
CHMP4A-202ENST00000524955 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa4.94□□□□□ -1.62
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