RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 CDC42EP1Q00587 391 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 CLUL1Q15846 466 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 ATL2Q8NHH9 583 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 RAB24Q969Q5 203 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 PGBD1Q96JS3 809 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 RNF7Q9UBF6 113 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-211ENST00000522045 CLSTN1O94985 981 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 GATA3P23771 443 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 SOX10P56693 466 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 DYRK1AQ13627 763 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 PTPRRQ15256 657 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 LPIN2Q92539 896 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 SNX19Q92543 992 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 HDAC10Q969S8 669 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 JKAMPQ9P055 326 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 CGB1A6NKQ9 187 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 TOR1BO14657 336 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 SBK3P0C264 359 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 SLC16A1P53985 500 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 PIGFQ07326 219 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 IFI44Q8TCB0 444 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 HASPINQ8TF76 798 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.51□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 SGTAO43765 313 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 NDUFS2O75306 463 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 SUN1O94901 812 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 CHRM2P08172 466 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 TXNRD1Q16881 649 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 ZNF365Q70YC5 407 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.5□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 ADM5C9JUS6 153 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 SLC43A1O75387 559 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 CD1AP06126 327 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 ITIH3Q06033 890 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 RAB39AQ14964 217 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.49□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 WIPF3A6NGB9 483 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 LINC00473A8K010 186 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 E7ENX8 843 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 PPP3CBP16298 524 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 NXPH1P58417 271 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 MC2RQ01718 297 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 TAP2Q03519 686 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 FAM153CQ494X1 144 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 TMIEQ8NEW7 156 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.48□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 ELFN1P0C7U0 828 aa6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 ZNF81P51508 661 aa6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 CNTD1Q8N815 330 aa6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 PDPRQ8NCN5 879 aa6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 TMX1Q9H3N1 280 aa6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 MKS1Q9NXB0 559 aa6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 USP35Q9P2H5 1018 aa6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 MCM8Q9UJA3 840 aa6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.47□□□□□ -1.37
SGCE-211ENST00000522045 ANXA1P04083 346 aa6.46□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 PRKCGP05129 697 aa6.46□□□□□ -1.38
SGCE-211ENST00000522045 ACAP2Q15057 778 aa6.46□□□□□ -1.38
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