RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520036.1

ACTBP6-201, Transcript of actin, beta pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP6, Length 1,090 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP6-201ENST00000520036 CYP3A43Q9HB55 503 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 PLCB1Q9NQ66 1216 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 DNAJB4Q9UDY4 337 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 SIX4Q9UIU6 781 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 FBXL5Q9UKA1 691 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 PTPRJQ12913 1337 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 H3BNC9 293 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 H7C4K7 107 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 TACC1O75410 805 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 FGF18O76093 207 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 KIF4AO95239 1232 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 VNN1O95497 513 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 LINC00271P0C7V0 271 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 CTNNB1P35222 781 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 RABGGTBP53611 331 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 UBASH3AP57075 661 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 FANCCQ00597 558 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 GCNT1Q02742 428 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 USP41Q3LFD5 358 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 WDR72Q3MJ13 1102 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 CBWD6Q4V339 395 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 CBWD3Q5JTY5 395 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 CBWD5Q5RIA9 395 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 FUT10Q6P4F1 479 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 METTL23Q86XA0 190 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 TAS1R2Q8TE23 839 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 VPS16Q9H269 839 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 TAB2Q9NYJ8 693 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 GCNT4Q9P109 453 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 IRAK3Q9Y616 596 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 LCHNA4D1U4 455 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 LPXNO60711 386 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 EFEMP2O95967 443 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 SOD2P04179 222 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 ATP1A3P13637 1013 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 FGFR3P22607 806 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 PCSK1P29120 753 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 LHX1P48742 406 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 MYL6P60660 151 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 UBXN1Q04323 297 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 SMARCB1Q12824 385 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 PTPROQ16827 1216 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 KIAA1841Q6NSI8 718 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 TRIM65Q6PJ69 517 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 DSTYKQ6XUX3 929 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 RNF214Q8ND24 703 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 PPP2R3CQ969Q6 453 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 SENP8Q96LD8 212 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 TTPALQ9BTX7 342 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 NUP58Q9BVL2 599 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 BCO2Q9BYV7 579 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 EDEM3Q9BZQ6 932 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 CXCL16Q9H2A7 254 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 MMRN2Q9H8L6 949 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 CHST7Q9NS84 486 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 MARCH5Q9NX47 278 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 APEX2Q9UBZ4 518 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 MAFFQ9ULX9 164 aa9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
ACTBP6-201ENST00000520036 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
ACTBP6-201ENST00000520036 OR6C75A6NL08 312 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTBP6-201ENST00000520036 CYB561D2O14569 222 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTBP6-201ENST00000520036 B4GALT3O60512 393 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTBP6-201ENST00000520036 OAZ2O95190 189 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTBP6-201ENST00000520036 URODP06132 367 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTBP6-201ENST00000520036 PON1P27169 355 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTBP6-201ENST00000520036 MFAP3P55082 362 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTBP6-201ENST00000520036 DSG1Q02413 1049 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTBP6-201ENST00000520036 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
ACTBP6-201ENST00000520036 TRIM14Q14142 442 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTBP6-201ENST00000520036 NR1I3Q14994 352 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTBP6-201ENST00000520036 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ACTBP6-201ENST00000520036 TIGD5Q53EQ6 642 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTBP6-201ENST00000520036 FIGNQ5HY92 759 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.9 ms