RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	CYP2D6	P10635	497 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	KRT9	P35527	623 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	IFNAR2	P48551	515 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	POLD2	P49005	469 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CDK8	P49336	464 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TFAP4	Q01664	338 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TROAP	Q12815	778 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SCARB2	Q14108	478 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RTN1	Q16799	776 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CFAP100	Q494V2	611 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CEP55	Q53EZ4	464 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	BNIPL	Q7Z465	357 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	LSMEM2	Q8N112	164 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SHC3	Q92529	594 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TBC1D5	Q92609	795 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP2A3	Q93084	1043 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC17	Q96LX7	622 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RUBCNL	Q9H714	662 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	DNAJC18	Q9H819	358 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SPON1	Q9HCB6	807 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ABCB6	Q9NP58	842 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	DSE	Q9UL01	958 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ELP1	O95163	1332 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971		E9PMD0	336 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971		F8W031	263 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971		H3BQV1	296 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971		H7C0S8	307 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SMIM22	K7EJ46	135 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	NFKBIE	O00221	500 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PSMD14	O00487	310 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	BNIP3L	O60238	219 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	DEXI	O95424	95 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MBD3	O95983	291 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	HLA-DOA	P06340	250 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PGR	P06401	933 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RSPH10B	P0C881	870 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	EPX	P11678	715 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	BMP4	P12644	408 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PDGFRA	P16234	1089 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FGFR3	P22607	806 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SOX6	P35712	828 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP5O	P48047	213 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MAPKAPK2	P49137	400 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	GNAQ	P50148	359 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SCNN1D	P51172	638 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	OLR1	P78380	273 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CBX1	P83916	185 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CXCL9	Q07325	125 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	REST	Q13127	1097 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PPFIA1	Q13136	1202 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	STIM1	Q13586	685 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		7.22	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MICU3	Q86XE3	530 aa		7.22	□□□□□ -1.25

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