RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP34-222	ENST00000498268	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP34-222	ENST00000498268	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
USP34-222	ENST00000498268	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	CHRM2	P08172	466 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	WAS	P42768	502 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	ZNF81	P51508	661 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	LINC00473	A8K010	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	PPP3CB	P16298	524 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	GPD1	P21695	349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	IL10RA	Q13651	578 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	PTPRR	Q15256	657 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	JADE3	Q92613	823 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268		K7ESF4	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	SLC43A1	O75387	559 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	CELA2A	P08217	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	EDNRB	P24530	442 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	HSD3B2	P26439	372 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	TFF2	Q03403	129 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	IPP	Q9Y573	584 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268		E9PLN8	166 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	NDUFS2	O75306	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	C5AR1	P21730	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	CLUL1	Q15846	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	ITGB6	P18564	788 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	KAT5	Q92993	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	TOR1B	O14657	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
USP34-222	ENST00000498268	CD1A	P06126	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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