RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	RABGGTA	Q92696	567 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	FGF13	Q92913	245 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	KXD1	Q9BQD3	176 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CSRNP2	Q9H175	543 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	MIOS	Q9NXC5	875 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PARP2	Q9UGN5	583 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PPME1	Q9Y570	386 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	SPTBN2	O15020	2390 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ACACB	O00763	2458 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D4	O60343	1298 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN1	O60635	241 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	AKAP5	P24588	427 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIK3	Q13003	919 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	XKR9	Q5GH70	373 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	FERMT3	Q86UX7	667 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR65	Q8IYL9	337 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	HASPIN	Q8TF76	798 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	NELL2	Q99435	816 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	EPC1	Q9H2F5	836 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	KLK14	Q9P0G3	267 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	OIP5	O43482	229 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	EDIL3	O43854	480 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	NPTXR	O95502	500 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CD33	P20138	364 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP3A7	P24462	503 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP2R5D	Q14738	602 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMD5	Q16401	504 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	LPAL2	Q16609	132 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ITFG1	Q8TB96	612 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ING5	Q8WYH8	240 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP63	Q96MT8	703 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	MBOAT7	Q96N66	472 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	LXN	Q9BS40	222 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CPLX1	O14810	134 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PAPLN	O95428	1278 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	EFEMP2	O95967	443 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNAR1	P17181	557 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	SPEM2	Q0P670	501 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	INF2	Q27J81	1249 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	RTP2	Q5QGT7	225 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	BLID	Q8IZY5	108 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC37A4	O43826	429 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ADRB1	P08588	477 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXA9	P31269	272 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	NRL	P54845	237 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PTEN	P60484	403 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP4A11	Q02928	519 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ADCY1	Q08828	1119 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP2R5C	Q13362	524 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PPM1J	Q5JR12	505 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PDXDC1	Q6P996	788 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		11.98	□□□□□ -0.49

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