RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 KRIT1O00522 736 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 ERLIN2O94905 339 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 FGGP02679 453 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 ITGA4P13612 1032 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 ATICP31939 592 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 GRM5P41594 1212 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 PSEN2P49810 448 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 MFSD10Q14728 455 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 PCDHGC3Q9UN70 934 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 C2CD2Q9Y426 696 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.29■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 HOXC8P31273 242 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 CPT1AP50416 773 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 HIC1Q14526 733 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 PPP2R5EQ16537 467 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 EMBQ6PCB8 327 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 CPNE8Q86YQ8 564 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 CAVIN3Q969G5 261 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 BTBD6Q96KE9 485 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 AP1M1Q9BXS5 423 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 CLSTN1O94985 981 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 HSPA6P17066 643 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 CYP2B6P20813 491 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 MMP8P22894 467 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 EPHB4P54760 987 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 NNTQ13423 1086 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 LIN9Q5TKA1 542 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 CD302Q8IX05 232 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 KLHL7Q8IXQ5 586 aa21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 WEE2P0C1S8 567 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 SREBF2Q12772 1141 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 CRHR2Q13324 411 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 KIZQ2M2Z5 673 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 SCLT1Q96NL6 688 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 ACAP3Q96P50 834 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 ANAPC7Q9UJX3 599 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 POLIQ9UNA4 740 aa21.27■■□□□ 1
NELFE-211ENST00000492185 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 CTGFP29279 349 aa21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 SLC1A1P43005 524 aa21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 TM4SF4P48230 202 aa21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 TMEM132DQ14C87 1099 aa21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 PASD1Q8IV76 773 aa21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 32.7
NELFE-211ENST00000492185 TFAP2BQ92481 460 aa21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 SEC14L1Q92503 715 aa21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 CCDC102AQ96A19 550 aa21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 SDCBP2Q9H190 292 aa21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 EPB41L5Q9HCM4 733 aa21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 NR2E1Q9Y466 385 aa21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.26■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 SPOPO43791 374 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 PAEPP09466 180 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 CYP2C9P11712 490 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 CD58P19256 250 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 GUCY2DQ02846 1103 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 PAK2Q13177 524 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 MAMLD1Q13495 774 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 TRIM7Q9C029 511 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 CDHR5Q9HBB8 845 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 ITGA11Q9UKX5 1188 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 DERAQ9Y315 318 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 PROSCO94903 275 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 ITGB3P05106 788 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 CARSP49589 748 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.25■□□□□ 0.99
NELFE-211ENST00000492185 HINFPQ9BQA5 517 aa21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms