RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NELFE-210ENST00000491139 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-210ENST00000491139 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-210ENST00000491139 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-210ENST00000491139 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NELFE-210ENST00000491139 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-210ENST00000491139 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NELFE-210ENST00000491139 NCANO14594 1321 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-210ENST00000491139 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 K7ESF4 209 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 JAK2O60674 1132 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 NPTX2P47972 431 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 PEX3P56589 373 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 ZNF174Q15697 407 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 ECM1Q16610 540 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 YIPF1Q9Y548 306 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 LARGE1O95461 756 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 KCNA4P22459 653 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 SOX9P48436 509 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 CEP68Q76N32 757 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 A0A1W2PRU2 124 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 PLD1Q13393 1074 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 IL31Q6EBC2 164 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 Q6ZS52 159 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 CEP295Q9C0D2 2601 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 PROZP22891 400 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 EPHB3P54753 998 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 ANAPC15P60006 121 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 BEST2Q8NFU1 509 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 LRRC3Q9BY71 257 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 ABLIM1O14639 778 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 HIP1RO75146 1068 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 OAZ2O95190 189 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 HOXA6P31267 233 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 CTHP32929 405 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 GUCY1B3Q02153 619 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 TMC8Q8IU68 726 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 DPYSL4O14531 572 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 WDR44Q5JSH3 913 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 DAW1Q8N136 415 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 TTC8Q8TAM2 541 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 DRC1Q96MC2 740 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-210ENST00000491139 M0QZQ0 153 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-210ENST00000491139 OR4Q2P0C623 313 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-210ENST00000491139 ALDH1A3P47895 512 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-210ENST00000491139 DUSP4Q13115 394 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-210ENST00000491139 PON2Q15165 354 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-210ENST00000491139 TTC38Q5R3I4 469 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-210ENST00000491139 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-210ENST00000491139 WDR5BQ86VZ2 330 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-210ENST00000491139 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-210ENST00000491139 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-210ENST00000491139 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-210ENST00000491139 DNM3Q9UQ16 869 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-210ENST00000491139 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
NELFE-210ENST00000491139 STK24Q9Y6E0 443 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-210ENST00000491139 SLC16A4O15374 487 aa22.69■■□□□ 1.22
NELFE-210ENST00000491139 VNN2O95498 520 aa22.69■■□□□ 1.22
NELFE-210ENST00000491139 LIMK1P53667 647 aa22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms