RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 CDR2Q01850 454 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 MTMR3Q13615 1198 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 PRPSAP1Q14558 356 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 DNAJC7Q99615 494 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 RNF186Q9NXI6 227 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 LAMB2P55268 1798 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 SGK1O00141 431 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 POMCP01189 267 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 BMP6P22004 513 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 RGS7P49802 495 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 MTF1Q14872 753 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 EFHC2Q5JST6 749 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 JADE1Q6IE81 842 aa8.77□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 CISHQ9NSE2 258 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 ATP5DP30049 168 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 ELF2Q15723 593 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 KRT12Q99456 494 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 INTUQ9ULD6 942 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 AKAP11Q9UKA4 1901 aa8.76□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 TISP43B9A030 160 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 F8VZ95 297 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC188H7C350 402 aa8.76□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 SPIRE1Q08AE8 756 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 BSPRYQ5W0U4 402 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF280DQ6N043 979 aa8.76□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.76□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.76□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 CCZ1BP86790 482 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.76□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 MAST2Q6P0Q8 1798 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 ARIH2O95376 493 aa8.76□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 GJA5P36382 358 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 ALDH1A3P47895 512 aa8.76□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 C17orf99Q6UX52 265 aa8.76□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 LGSNQ5TDP6 509 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 ACOT1Q86TX2 421 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 TIAM2Q8IVF5 1701 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM176AQ96HP8 235 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 SLITRK1Q96PX8 696 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 HIPK3Q9H422 1215 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 TGFB1I1O43294 461 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRD-211ENST00000486161 SELPP16109 830 aa8.75□□□□□ -1.01
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