RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484918.1

MRPL23-209, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, human

TSL 5

Gene MRPL23, Length 232 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL23-209	ENST00000484918	UBE4B	O95155	1302 aa		7.15	□□□□□ -1.26
MRPL23-209	ENST00000484918	NOTCH1	P46531	2555 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	CBX4	O00257	560 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	HBP1	O60381	514 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	ALDH1A2	O94788	518 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	OR1D2	P34982	312 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	ACADVL	P49748	655 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	GPC3	P51654	580 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	STAT5B	P51692	787 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	CLCN3	P51790	818 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	RUNX3	Q13761	415 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	CLCA4	Q14CN2	919 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	ATCAY	Q86WG3	371 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	SLC34A3	Q8N130	599 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	PGBD4	Q96DM1	585 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	AZI2	Q9H6S1	392 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	MIOS	Q9NXC5	875 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918		A0A1B0GTW7	788 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	TSPY2	A6NKD2	308 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	ENC1	O14682	589 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	MTSS1	O43312	755 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	MPO	P05164	745 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	GNS	P15586	552 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	MAOB	P27338	520 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	SREBF1	P36956	1147 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	CDR1	P51861	262 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	PSMD2	Q13200	908 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	DNAJC3	Q13217	504 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	CLN3	Q13286	438 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	POLA2	Q14181	598 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	TBR1	Q16650	682 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	LSMEM2	Q8N112	164 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	MARVELD3	Q96A59	401 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		7.13	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	PCDHGA12	O60330	932 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	PRAMEF12	O95522	483 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	PRKCG	P05129	697 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	MYL4	P12829	197 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	MCM2	P49736	904 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	GABRE	P78334	506 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	RABGGTA	Q92696	567 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	SGF29	Q96ES7	293 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	LRRC3	Q9BY71	257 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	EBF3	Q9H4W6	596 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	GKN1	Q9NS71	199 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	CEP72	Q9P209	647 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	7.11	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918		K7EQS6	105 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	N4BP3	O15049	544 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	ARSA	P15289	507 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	ATP4A	P20648	1035 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	GNLY	P22749	145 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	GJA4	P35212	333 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	LSS	P48449	732 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	TDO2	P48775	406 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	SLC26A2	P50443	739 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	USP11	P51784	963 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MRPL23-209	ENST00000484918	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27

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