RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 PDXKO00764 312 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 ZMYND10O75800 440 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 OAZ2O95190 189 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 NFICP08651 508 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 POU2F2P09086 479 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 ODC1P11926 461 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 TAF6P49848 677 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 LILRA4P59901 499 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 DPYDQ12882 1025 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 MYBPC2Q14324 1141 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 SV2CQ496J9 727 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 HPS3Q969F9 1004 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 SAAL1Q96ER3 474 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 TRIOO75962 3097 aa14.43□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 OR6C75A6NL08 312 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 TGFB1I1O43294 461 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 TBC1D4O60343 1298 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 XYLBO75191 536 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 SMC2O95347 1197 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 CASP1P29466 404 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 ELF1P32519 619 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 HOXD13P35453 343 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 METTL23Q86XA0 190 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 WDR49Q8IV35 697 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 GSDMAQ96QA5 445 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 FNBP1Q96RU3 617 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 PIDD1Q9HB75 910 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 I3L4J1 428 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 ABLIM3O94929 683 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 TNNC2P02585 160 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 ATF2P15336 505 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 AP3M2P53677 418 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 RBP5P82980 135 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 SMARCB1Q12824 385 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 MYO1EQ12965 1108 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 STK4Q13043 487 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 RNF135Q8IUD6 432 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 SPATA18Q8TC71 538 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 APOL5Q9BWW9 433 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 KCNH6Q9H252 994 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 INTS13Q9NVM9 706 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.41□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 DENND4AQ7Z401 1863 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 KPNA7A9QM74 516 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 EXOC3O60645 756 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 CYP11A1P05108 521 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 C8AP07357 584 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 ROR1Q01973 937 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 OVOS1Q6IE37 1185 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 TCEAL8Q8IYN2 117 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 ENGASEQ8NFI3 743 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 SENP8Q96LD8 212 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 POMKQ9H5K3 350 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-211ENST00000476336 PDE11AQ9HCR9 933 aa14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms