RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474246.1

SMARCE1-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 2,124 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-208ENST00000474246 TNFAIP2Q03169 654 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC14A1Q13336 389 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 LRP8Q14114 963 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 Q4G0T1 1027 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 AARDQ4LEZ3 155 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 TCTE1Q5JU00 501 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 OR8K3Q8NH51 312 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 FBXO27Q8NI29 283 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 AIFM3Q96NN9 605 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 ACPTQ9BZG2 426 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 ROCK1Q13464 1354 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 A6NLC8 198 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM232C9JQI7 657 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 PSMD9O00233 223 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 E2F3O00716 465 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 MAGEB3O15480 346 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 KCNH1O95259 989 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 ASGR1P07306 291 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 SCG2P13521 617 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 ALADP13716 330 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 HLA-DPA1P20036 260 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 VCPP55072 806 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 GUCY1B3Q02153 619 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 TRPC3Q13507 836 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 CRYMQ14894 314 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 LETM2Q2VYF4 491 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 LUZP1Q86V48 1076 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 SPARTQ8N0X7 666 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 CPA6Q8N4T0 437 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 CEP76Q8TAP6 659 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 IFI44Q8TCB0 444 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 COG1Q8WTW3 980 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 NYXQ9GZU5 481 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 FANCEQ9HB96 536 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 PDE7BQ9NP56 450 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 AAASQ9NRG9 546 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 FBXO40Q9UH90 709 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 PPT2Q9UMR5 302 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 UQCRHLA0A096LP55 91 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 SMPD2O60906 423 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 UQCRHP07919 91 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 GJB1P08034 283 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 CLTBP09497 229 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 MAPKAPK2P49137 400 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 FNTAP49354 379 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 SPAG1Q07617 926 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 CETN1Q12798 172 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 STIM1Q13586 685 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 SNX1Q13596 522 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 SASS6Q6UVJ0 657 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 TMC6Q7Z403 805 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 CREG2Q8IUH2 290 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 ITPRIPQ8IWB1 547 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 PRR18Q8N4B5 295 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 HSPH1Q92598 858 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 TCEANC2Q96MN5 208 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 AMACRQ9UHK6 382 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-208ENST00000474246 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.49□□□□□ -1.37
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