RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 RPL9P32969 192 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SLC12A3P55017 1021 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 HYIQ5T013 277 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 HAUS3Q68CZ6 603 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SLC39A4Q6P5W5 647 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ZNF852Q6ZMS4 543 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 Q6ZS52 159 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 GAREM2Q75VX8 874 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SMARCD2Q92925 531 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 CHFRQ96EP1 664 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 FIZ1Q96SL8 496 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 BRD9Q9H8M2 597 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TRPV4Q9HBA0 871 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ZFP14Q9HCL3 533 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 A0A1W2PRU2 124 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 LACTBL1A8MY62 500 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TISP43B9A030 160 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 K7ESF4 209 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TOM1L1O75674 476 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 OAZ2O95190 189 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ADRB2P07550 413 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PSMC3P17980 439 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 CCNE1P24864 410 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 GUCY2CP25092 1073 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 MCM4P33991 863 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 YARSP54577 528 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 GRIN1Q05586 938 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 MCL1Q07820 350 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 DUSP4Q13115 394 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TPGS2Q68CL5 300 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PKN3Q6P5Z2 889 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ATAD1Q8NBU5 361 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 OR10T2Q8NGX3 314 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TTC8Q8TAM2 541 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 RIN3Q8TB24 985 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ATRIPQ8WXE1 791 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 FAM3CQ92520 227 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ZFYVE19Q96K21 471 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 NELL2Q99435 816 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TRPV5Q9NQA5 729 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 SLC38A7Q9NVC3 462 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 DNM3Q9UQ16 869 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 PIAS3Q9Y6X2 628 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 CITO14578 2027 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 USP24Q9UPU5 2620 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-206ENST00000474188 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 PLS3P13797 630 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ELF1P32519 619 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 MAGEA9P43362 315 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 WNT7BP56706 349 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 TMEM119Q4V9L6 283 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CENPPQ6IPU0 288 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ZNF280DQ6N043 979 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 MFSD6LQ8IWD5 586 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 FAM84AQ96KN4 292 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 TCHPQ9BT92 498 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 IL21Q9HBE4 155 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 NCDNQ9UBB6 729 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 NUB1Q9Y5A7 615 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 MTMR11A4FU01 709 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 SLC38A8A6NNN8 435 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 H7C4K7 107 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 GDF9O60383 454 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 PRAMEF12O95522 483 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 PLA2G4BP0C869 781 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 FNTBP49356 437 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 NCKAP1LP55160 1127 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 TNK2Q07912 1038 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 FCHO2Q0JRZ9 810 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 SPEM2Q0P670 501 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 ZPBP2Q6X784 338 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 LRRTM3Q86VH5 581 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-206ENST00000474188 KCNN1Q92952 543 aa11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms