RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472880.1

COL9A3-210, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 959 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-210ENST00000472880 ASAH2Q9NR71 780 aa21.47■■□□□ 1.03
COL9A3-210ENST00000472880 YIPF1Q9Y548 306 aa21.47■■□□□ 1.03
COL9A3-210ENST00000472880 R4GN57 208 aa21.47■■□□□ 1.03
COL9A3-210ENST00000472880 A0A0B4J269 797 aa21.46■■□□□ 1.03
COL9A3-210ENST00000472880 OAZ2O95190 189 aa21.46■■□□□ 1.03
COL9A3-210ENST00000472880 SP9P0CG40 484 aa21.46■■□□□ 1.03
COL9A3-210ENST00000472880 CCR2P41597 374 aa21.46■■□□□ 1.03
COL9A3-210ENST00000472880 GUCY2FP51841 1108 aa21.46■■□□□ 1.03
COL9A3-210ENST00000472880 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.46■■□□□ 1.03
COL9A3-210ENST00000472880 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.46■■□□□ 1.03
COL9A3-210ENST00000472880 BEST2Q8NFU1 509 aa21.46■■□□□ 1.03
COL9A3-210ENST00000472880 ZFP14Q9HCL3 533 aa21.46■■□□□ 1.03
COL9A3-210ENST00000472880 LTB4R2Q9NPC1 389 aa21.46■■□□□ 1.03
COL9A3-210ENST00000472880 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
COL9A3-210ENST00000472880 CEP72Q9P209 647 aa21.46■■□□□ 1.03
COL9A3-210ENST00000472880 CFAP54Q96N23 3096 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 OR6C75A6NL08 312 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 FAM170BA6NMN3 283 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 LMNAP02545 664 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 OR4Q2P0C623 313 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 MYL4P12829 197 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 CD72P21854 359 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 FCARP24071 287 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 MAGEA9P43362 315 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 PLD1Q13393 1074 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 SPATA1Q5VX52 437 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 JADE1Q6IE81 842 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 POTEHQ6S545 545 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 CD302Q8IX05 232 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 DNASE1L2Q92874 299 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 ASB16Q96NS5 453 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 CCSER1Q9C0I3 900 aa21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.44■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 ADRB2P07550 413 aa21.44■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 ODC1P11926 461 aa21.44■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 TYMPP19971 482 aa21.44■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 PDCP20941 246 aa21.44■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 GTF2BQ00403 316 aa21.44■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 GRM2Q14416 872 aa21.44■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 TMEM132DQ14C87 1099 aa21.44■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 OVOS1Q6IE37 1185 aa21.44■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.44■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 FIZ1Q96SL8 496 aa21.44■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 BRD9Q9H8M2 597 aa21.44■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 HEBP1Q9NRV9 189 aa21.44■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 PATJQ8NI35 1801 aa21.43■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 NCAM2O15394 837 aa21.43■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 LAMTOR5O43504 91 aa21.43■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 NFICP08651 508 aa21.43■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 EPHA5P54756 1037 aa21.43■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 ZNF852Q6ZMS4 543 aa21.43■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 SMARCD2Q92925 531 aa21.43■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 NELL2Q99435 816 aa21.43■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa21.43■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.43■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 PPEF2O14830 753 aa21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 PAX3P23760 479 aa21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 DDIT3P35638 169 aa21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 TSC2P49815 1807 aa21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 EPHB3P54753 998 aa21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 LILRA4P59901 499 aa21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 GPR17Q13304 367 aa21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 CUL4AQ13619 759 aa21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 MYBPC2Q14324 1141 aa21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 ADALQ6DHV7 355 aa21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 SLFN12LQ6IEE8 588 aa21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 EPSTI1Q96J88 318 aa21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 STK17AQ9UEE5 414 aa21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 DERAQ9Y315 318 aa21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 CLIC4Q9Y696 253 aa21.42■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 FAM186AA6NE01 2351 aa21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 MOSPD3O75425 235 aa21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 VNN2O95498 520 aa21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 GJA1P17302 382 aa21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 TXLNAP40222 546 aa21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 ALDH1A3P47895 512 aa21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 ACOT2P49753 483 aa21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 DUSP4Q13115 394 aa21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 TEAD2Q15562 447 aa21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 C9orf57Q5W0N0 161 aa21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 VITQ6UXI7 678 aa21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 DYMQ7RTS9 669 aa21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 SFR1Q86XK3 245 aa21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.41■■□□□ 1.02
COL9A3-210ENST00000472880 IRF7Q92985 503 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms