RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 KYAT1Q16773 422 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF568Q3ZCX4 644 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 ERMARDQ5T6L9 678 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 RHBDF2Q6PJF5 856 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF365Q70YC5 407 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 CCDC77Q9BR77 488 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 NIF3L1Q9GZT8 377 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 CCDC113Q9H0I3 377 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.269e-15■■■■■ 186.3
SUCLG2-202ENST00000460567 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 PCDHGC3Q9UN70 934 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 DOCK5Q9H7D0 1870 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 UMODL1Q5DID0 1318 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TLR3O15455 904 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 MED7O43513 233 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 CAND2O75155 1236 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TJP3O95049 919 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 IL18RAPO95256 599 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 POU5F1BQ06416 359 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TRPM4Q8TD43 1214 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 PCYT2Q99447 389 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 PPCSQ9HAB8 311 aa16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 MSCO60682 206 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TNNC2P02585 160 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 RDXP35241 583 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 CNTN2Q02246 1040 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TRPC3Q13507 836 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 VGLL4Q14135 290 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 CCDC50Q8IVM0 306 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 NIPA2Q8N8Q9 360 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF606Q8WXB4 792 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 RAPGEF5Q92565 580 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 CHMP6Q96FZ7 201 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 C11orf70Q9BRQ4 267 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TCHPQ9BT92 498 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 NFKBIZQ9BYH8 718 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 OSBPL8Q9BZF1 889 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 HAPLN2Q9GZV7 340 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 EFR3BQ9Y2G0 817 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 PTPN22Q9Y2R2 807 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 NUB1Q9Y5A7 615 aa16.67■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 SOWAHBA6NEL2 793 aa16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 B4GALT4O60513 344 aa16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 FSBPO95073 299 aa16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 PRKCBP05771 671 aa16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 NCAPG2Q86XI2 1143 aa16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 WDR35Q9P2L0 1181 aa16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 ANAPC5Q9UJX4 755 aa16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 LRRC37A2A6NM11 1700 aa16.66■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 PTPRJQ12913 1337 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 PTPRFP10586 1907 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TMEM191CA6NGB0 347 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 NOP56O00567 594 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 ACKR2O00590 384 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TRIM66O15016 1216 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TTC4O95801 387 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TMEM191BP0C7N4 346 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 ADCY8P40145 1251 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 GSCP56915 257 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 C6orf89Q6UWU4 347 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 MPZL3Q6UWV2 235 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 POLNQ7Z5Q5 900 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 CPLX4Q7Z7G2 160 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 ERO1BQ86YB8 467 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 TTC39CQ8N584 583 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 ANKS4BQ8N8V4 417 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.65■□□□□ 0.26
SUCLG2-202ENST00000460567 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms