RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 SCNN1GP51170 649 aa22.41■■□□□ 1.18
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SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 HIPK3Q9H422 1215 aa22.41■■□□□ 1.18
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SH3BP2-204ENST00000452765 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.37■■□□□ 1.17
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SH3BP2-204ENST00000452765 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 ANO9A1A5B4 782 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 VAV2P52735 878 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 BCO2Q9BYV7 579 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-204ENST00000452765 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
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