RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439476.6

BDNF-211, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,532 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-211ENST00000439476 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.7□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 PALB2Q86YC2 1186 aa6.7□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.7□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 CCT7Q99832 543 aa6.7□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.7□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 AGPSO00116 658 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 HAUS5O94927 633 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 GDF11O95390 407 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 CYP1A2P05177 515 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 FMO5P49326 533 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 ITKQ08881 620 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 MAPK7Q13164 816 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 GRAPQ13588 217 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 ITIH4Q14624 930 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 BBS9Q3SYG4 887 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 CD302Q8IX05 232 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 SMYD1Q8NB12 490 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 SH3GL2Q99962 352 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 KCND2Q9NZV8 630 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 K7ERI5 159 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 GSTA4O15217 222 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 CDH16O75309 829 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 ASNSP08243 561 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 PON1P27169 355 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 COPS2P61201 443 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 OCA2Q04671 838 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 TRADDQ15628 312 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 KYNUQ16719 465 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 WLSQ5T9L3 541 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 IQCKQ8N0W5 287 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 MREGQ8N565 214 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 DYDC2Q96IM9 177 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 CD209Q9NNX6 404 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 SEPT10Q9P0V9 454 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 BCS1LQ9Y276 419 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 EMSYQ7Z589 1322 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 RASSF10A6NK89 507 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 WDR64B1ANS9 1081 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 SPAG6O75602 509 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 DDHD2O94830 711 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 CAMTA2O94983 1202 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 NTSR2O95665 410 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 ATP6V1G2O95670 118 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 BAG6P46379 1132 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 VAMP7P51809 220 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 CDR2Q01850 454 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 PPP2R5CQ13362 524 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 SPOPLQ6IQ16 392 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 C4orf22Q6V702 233 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 MTBPQ96DY7 904 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 CALN1Q9BXU9 219 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 TOM1L1O75674 476 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 UPP2O95045 317 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 EYA4O95677 639 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 SERPINB2P05120 415 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 GHRP10912 638 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 COMTP21964 271 aa6.69□□□□□ -1.34
BDNF-211ENST00000439476 PRELPP51888 382 aa6.69□□□□□ -1.34
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