RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 SHKBP1Q8TBC3 707 aa16.3■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 RSPRY1Q96DX4 576 aa16.3■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 LRRC3Q9BY71 257 aa16.3■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 PCDHB8Q9UN66 801 aa16.3■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 HIP1RO75146 1068 aa16.29■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 OAZ2O95190 189 aa16.29■□□□□ 0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 MAPK7Q13164 816 aa16.29■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 LRRC32Q14392 662 aa16.29■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 PPM1JQ5JR12 505 aa16.29■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.29■□□□□ 0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa16.29■□□□□ 0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 YIPF1Q9Y548 306 aa16.29■□□□□ 0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 E9PMD0 336 aa16.28■□□□□ 0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 TRAPPC10P48553 1259 aa16.28■□□□□ 0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 WDR44Q5JSH3 913 aa16.28■□□□□ 0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 YAF2Q8IY57 180 aa16.28■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 IGSF22Q8N9C0 903 aa16.28■□□□□ 0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 DRC1Q96MC2 740 aa16.28■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 SLC38A8A6NNN8 435 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC16A4O15374 487 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 C1orf186Q6ZWK4 172 aa16.27■□□□□ 0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 LRRC3BQ96PB8 259 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 RUSC1Q9BVN2 902 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 GDF9O60383 454 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 LRPAP1P30533 357 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP16.26■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 EPHB3P54753 998 aa16.26■□□□□ 0.19
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ACTBP11-201ENST00000436287 Q6ZS52 159 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
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ACTBP11-201ENST00000436287 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 MKNK1Q9BUB5 465 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 KCNG1Q9UIX4 513 aa16.26■□□□□ 0.19
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ACTBP11-201ENST00000436287 SFI1A8K8P3 1242 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 OR4Q2P0C623 313 aa16.25■□□□□ 0.19
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ACTBP11-201ENST00000436287 ALDH1A3P47895 512 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 MCL1Q07820 350 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 STRN3Q13033 797 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 NBR1Q14596 966 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.25■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 ZBTB6Q15916 424 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 STXBP5Q5T5C0 1151 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 KRT79Q5XKE5 535 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 CENPPQ6IPU0 288 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 ZPBP2Q6X784 338 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTBP11-201ENST00000436287 GAREM2Q75VX8 874 aa16.25■□□□□ 0.19
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