RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418646.5

GPCPD1-202, Transcript of glycerophosphocholine phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 5

Gene GPCPD1, Length 4,015 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1-202ENST00000418646 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 DENND3A2RUS2 1198 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 TRIM64BA6NI03 449 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 PES1O00541 588 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 EXOC3O60645 756 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 ASS1P00966 412 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 PRKCHP24723 683 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 RAP1GDS1P52306 607 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 CRYMQ14894 314 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 AMHR2Q16671 573 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 KCTD16Q68DU8 428 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 TRNP1Q6NT89 227 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 TIFABQ6ZNK6 161 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 SV2AQ7L0J3 742 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 KSR1Q8IVT5 923 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 ABRAQ8N0Z2 381 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 CCDC24Q8N4L8 307 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 MIEF2Q96C03 454 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 TEKT3Q9BXF9 490 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 PORCNQ9H237 461 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 DNAJB4Q9UDY4 337 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 C15orf41Q9Y2V0 281 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 SAMM50Q9Y512 469 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 TEX264Q9Y6I9 313 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 HELZP42694 1942 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 SMAPO00193 183 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 NFIBO00712 420 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 GH1P01241 217 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 GH2P01242 217 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 DLDP09622 509 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 NQO1P15559 274 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 IL4RP24394 825 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 YWHABP31946 246 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 QARSP47897 775 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 GUCY2FP51841 1108 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 BLMHQ13867 455 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 GRM2Q14416 872 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 KRT72Q14CN4 511 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 MORF4L2Q15014 288 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 CCDC70Q6NSX1 233 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 MICALCLQ6ZW33 695 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 TICAM1Q8IUC6 712 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 CBWD2Q8IUF1 395 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 MCRS1Q96EZ8 462 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 GORASP1Q9BQQ3 440 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 TRIM7Q9C029 511 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 HOMER3Q9NSC5 361 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 RAB20Q9NX57 234 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 MTMR10Q9NXD2 777 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 STK32BQ9NY57 414 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 KLHL14Q9P2G3 628 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 LTBP2Q14767 1821 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 UTRNP46939 3433 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 CLIC2O15247 247 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 EXTL3O43909 919 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 GCNT3O95395 438 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 HOXC6P09630 235 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 CCDC172P0C7W6 258 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 POLR2MP0CAP2 368 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 LIG3P49916 1009 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 RPL26P61254 145 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 HAUS6Q7Z4H7 955 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 MDM1Q8TC05 714 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 PIGOQ8TEQ8 1089 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 TRIM11Q96F44 468 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 DRC1Q96MC2 740 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 KATNBL1Q9H079 304 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 C1orf21Q9H246 121 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 SAR1AQ9NR31 198 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 VWA8A3KMH1 1905 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.657e-8■■■■■ 30.2
GPCPD1-202ENST00000418646 PDLIM1O00151 329 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 CNMDO75829 334 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 GABBR2O75899 941 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 PFKMP08237 780 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 KRT16P08779 473 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 CNGA1P29973 690 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 HOXC8P31273 242 aa4.75□□□□□ -1.65
GPCPD1-202ENST00000418646 CPOXP36551 454 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms