RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 RUNX1T1Q06455 604 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 C16orf86Q6ZW13 317 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PACS2Q86VP3 889 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SCFD1Q8WVM8 642 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SH3KBP1Q96B97 665 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2Q2LH0YL09 131 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 KCNA1Q09470 495 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 INPP5AQ14642 412 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 NAB2Q15742 525 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM69Q86WT6 500 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 BBS7Q8IWZ6 715 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ASIC4Q96FT7 647 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 FBXO40Q9UH90 709 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SASH3O75995 380 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 MYBL1P10243 752 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ITIH2P19823 946 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 LAMB3Q13751 1172 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 RNF135Q8IUD6 432 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 OR6B3Q8NGW1 331 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TBC1D16Q8TBP0 767 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM245Q9H330 911 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CASS4Q9NQ75 786 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 UBE4BO95155 1302 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 MYMKA6NI61 221 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PIK3R2O00459 728 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 BNIP3LO60238 219 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 S100A5P33763 92 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PPP4CP60510 307 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 LAMC2Q13753 1193 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SEC23AQ15436 765 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CRAMP1Q96RY5 1269 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 EGFL8Q99944 293 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 IP6K2Q9UHH9 426 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 NEU2Q9Y3R4 380 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 NQO1P15559 274 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 MTFR1Q15390 333 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 MIGA2Q7L4E1 593 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 APPL2Q8NEU8 664 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 EME1Q96AY2 570 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ALG6Q9Y672 507 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SALL1Q9NSC2 1324 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PDXKO00764 312 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 HUS1O60921 280 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TFRCP02786 760 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00116Q8NCU8 138 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 VCPKMTQ9H867 229 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 RGL1Q9NZL6 768 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 DCCP43146 1447 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 RTN2O75298 545 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 APOA4P06727 396 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CDH6P55285 790 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 ROR1Q01973 937 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 OVGP1Q12889 678 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 STX3Q13277 289 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 Q3C1V9 767 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 DNAL1Q4LDG9 190 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM72Q6ZMU5 477 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 PRUNE1Q86TP1 453 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 DAGLBQ8NCG7 672 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SH2D3AQ9BRG2 576 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SLC26A4O43511 780 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 COMTP21964 271 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SDC4P31431 198 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 VHLP40337 213 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 RCN1Q15293 331 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 LVRNQ6Q4G3 990 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SMIM5Q71RC9 77 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 STK33Q9BYT3 514 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 HAO1Q9UJM8 370 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-202ENST00000400053 MYO3BQ8WXR4 1341 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms