RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399201.5

SETD4-202, Transcript of SET domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SETD4, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4-202ENST00000399201 GPRC5CQ9NQ84 441 aa11.92□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 DTNBO60941 627 aa11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 CHRNB1P11230 501 aa11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 FNTBP49356 437 aa11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 LIMK1P53667 647 aa11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 SATB1Q01826 763 aa11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 RESTQ13127 1097 aa11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 PTGDRQ13258 359 aa11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 ATF7IP2Q5U623 682 aa11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 VITQ6UXI7 678 aa11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 APPL2Q8NEU8 664 aa11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 TRPV4Q9HBA0 871 aa11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 TMEM63CQ9P1W3 806 aa11.91□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 BAHCC1Q9P281 2608 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 SDK1Q7Z5N4 2213 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 PODXLO00592 558 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 DPYSL4O14531 572 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 CHADO15335 359 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 MYL4P12829 197 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 CPB1P15086 417 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 RPL9P32969 192 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 BRCC3P46736 316 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 TRIM29Q14134 588 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 PTPAQ15257 358 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 CTXN3Q4LDR2 81 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 ATL3Q6DD88 541 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 PADI6Q6TGC4 694 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 LRSAM1Q6UWE0 723 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 GAS2L3Q86XJ1 694 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 SYNPOQ8N3V7 929 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 OXER1Q8TDS5 423 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 KIFAP3Q92845 792 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 TCEAL4Q96EI5 215 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 LOXL4Q96JB6 756 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 CCDC113Q9H0I3 377 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 CFAP45Q9UL16 551 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 MYH11P35749 1972 aa11.9□□□□□ -0.5
SETD4-202ENST00000399201 ATRXP46100 2492 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 SHISA7A6NL88 538 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 HEPACAM2A8MVW5 462 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 I3L4J1 428 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 K7ERI5 159 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 HRO43593 1189 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 FGF19O95750 216 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 CYP11B2P19099 503 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 HOXA6P31267 233 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 SHC2P98077 582 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 TWF1Q12792 350 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 CCDC183Q5T5S1 534 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 HAUS3Q68CZ6 603 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 WDR5BQ86VZ2 330 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 FBXL5Q9UKA1 691 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 SYCE3A1L190 88 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 GDF9O60383 454 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 ATG13O75143 517 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 MUTP22033 750 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 PMLP29590 882 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 VIPR2P41587 438 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 GRM5P41594 1212 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 EPHB3P54753 998 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 EPHA5P54756 1037 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 PLCB2Q00722 1185 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 NR5A1Q13285 461 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 ZNF568Q3ZCX4 644 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 EEF1DP3Q658K8 133 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 CATSPER3Q86XQ3 398 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 C3orf58Q8NDZ4 430 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 C8orf76Q96K31 380 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 SPATA32Q96LK8 384 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 ACAP3Q96P50 834 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 TCHPQ9BT92 498 aa11.88□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa11.87□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 MYBPHLA2RUH7 354 aa11.87□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.87□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.87□□□□□ -0.51
SETD4-202ENST00000399201 SLC38A8A6NNN8 435 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms