RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380075.6

TRIM54-202, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 1,967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-202ENST00000380075 PARP2Q9UGN5 583 aa22.98■■□□□ 1.27
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TRIM54-202ENST00000380075 SLC26A2P50443 739 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
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TRIM54-202ENST00000380075 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 WDR49Q8IV35 697 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 GPR20Q99678 358 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 FAM170AA1A519 330 aa22.96■■□□□ 1.27
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TRIM54-202ENST00000380075 PYGMP11217 842 aa22.96■■□□□ 1.27
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TRIM54-202ENST00000380075 LIN9Q5TKA1 542 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 DPH5Q9H2P9 285 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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TRIM54-202ENST00000380075 H0YGN5 161 aa22.96■■□□□ 1.27
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TRIM54-202ENST00000380075 MSCO60682 206 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 PPFIA2O75334 1257 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 PTGIRP43119 386 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 GLG1Q92896 1179 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 TMBIM4Q9HC24 238 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 NFS1Q9Y697 457 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM54-202ENST00000380075 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 INHAP05111 366 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 EDN1P05305 212 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 MYZAPP0CAP1 466 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 NCOA4Q13772 614 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 MON1BQ7L1V2 547 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 BTBD6Q96KE9 485 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 GNA15P30679 374 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 IRAK1P51617 712 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 MAPK6Q16659 721 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 AADACL2Q6P093 401 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 MYO1FO00160 1098 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 FSCN2O14926 492 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 OGTO15294 1046 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 PPFIA4O75335 1185 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 MCL1Q07820 350 aa22.94■■□□□ 1.26
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TRIM54-202ENST00000380075 PTP4A2Q12974 167 aa22.94■■□□□ 1.26
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TRIM54-202ENST00000380075 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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TRIM54-202ENST00000380075 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 C18orf8Q96DM3 657 aa22.94■■□□□ 1.26
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TRIM54-202ENST00000380075 SCINQ9Y6U3 715 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 FAM189A1O60320 539 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 ARIH2O95376 493 aa22.93■■□□□ 1.26
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TRIM54-202ENST00000380075 NOMO3P69849 1222 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 TMEM270Q6UE05 265 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 TRPV1Q8NER1 839 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.93■■□□□ 1.26
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TRIM54-202ENST00000380075 KATNBL1Q9H079 304 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 LRRC19Q9H756 370 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 NR1D1P20393 614 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-202ENST00000380075 RRM1P23921 792 aa22.92■■□□□ 1.26
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