RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368460.7

PBXIP1-201, Transcript of PBX homeobox interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene PBXIP1, Length 1,175 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBXIP1-201ENST00000368460 EPHB3P54753 998 aa20.15■□□□□ 0.82
PBXIP1-201ENST00000368460 ST3GAL2Q16842 350 aa20.15■□□□□ 0.82
PBXIP1-201ENST00000368460 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PBXIP1-201ENST00000368460 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.15■□□□□ 0.82
PBXIP1-201ENST00000368460 USP37Q86T82 979 aa20.15■□□□□ 0.82
PBXIP1-201ENST00000368460 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.15■□□□□ 0.82
PBXIP1-201ENST00000368460 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PBXIP1-201ENST00000368460 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.15■□□□□ 0.82
PBXIP1-201ENST00000368460 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.15■□□□□ 0.82
PBXIP1-201ENST00000368460 DNM3Q9UQ16 869 aa20.15■□□□□ 0.82
PBXIP1-201ENST00000368460 YIPF1Q9Y548 306 aa20.15■□□□□ 0.82
PBXIP1-201ENST00000368460 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.14■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 CNR2P34972 360 aa20.14■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 NEK4P51957 841 aa20.14■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 ECM1Q16610 540 aa20.14■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 PRR23CQ6ZRP0 262 aa20.14■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.14■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.14■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 A0A1W2PRU2 124 aa20.13■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 CHADO15335 359 aa20.13■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 MOSPD3O75425 235 aa20.13■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 ALDH1A3P47895 512 aa20.13■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 EPHA5P54756 1037 aa20.13■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 PTGDRQ13258 359 aa20.13■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 CSRP2Q16527 193 aa20.13■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 LONP2Q86WA8 852 aa20.13■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.13■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.13■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.13■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 SLC16A4O15374 487 aa20.12■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 DGKKQ5KSL6 1271 aa20.12■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 KRT79Q5XKE5 535 aa20.12■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 IL31Q6EBC2 164 aa20.12■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.12■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.12■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 COL4A2P08572 1712 aa20.11■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 E9PMD0 336 aa20.11■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 HRO43593 1189 aa20.11■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 SOX9P48436 509 aa20.11■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 SMTNP53814 917 aa20.11■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 SEZ6Q53EL9 994 aa20.11■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.11■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.11■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.11■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.11■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 TTC8Q8TAM2 541 aa20.11■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.11■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 CLDN3O15551 220 aa20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 TOM1L1O75674 476 aa20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 OR4Q2P0C623 313 aa20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 PROZP22891 400 aa20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 TRAPPC10P48553 1259 aa20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 DMWDQ09019 674 aa20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 DUSP4Q13115 394 aa20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 GAS6Q14393 721 aa20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 PDIA5Q14554 519 aa20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 KIF12Q96FN5 646 aa20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 BICD1Q96G01 975 aa20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 NCANO14594 1321 aa20.09■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 OR6C75A6NL08 312 aa20.09■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 ARNTLO00327 626 aa20.09■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 FGF19O95750 216 aa20.09■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 CXCL8P10145 99 aa20.09■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 SPAG1Q07617 926 aa20.09■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.09■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.09■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 Q6ZS52 159 aa20.09■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 DAW1Q8N136 415 aa20.09■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 GCNAQ96QF7 691 aa20.09■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 TIPINQ9BVW5 301 aa20.09■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.08■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 SFI1A8K8P3 1242 aa20.08■□□□□ 0.81
PBXIP1-201ENST00000368460 ABLIM1O14639 778 aa20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms