RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 P3H2Q8IVL5 708 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBED8Q8IZ13 594 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 GALNT4Q8N4A0 578 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ARL10Q8N8L6 244 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 MDM1Q8TC05 714 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 SDR42E1Q8WUS8 393 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 KMT5AQ9NQR1 393 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ZSCAN32Q9NX65 697 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 E5RI56 91 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PCSK2P16519 638 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ERFP50548 548 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 HK2P52789 917 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 AP1S2P56377 157 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC142Q17RM4 750 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 C17orf50Q8WW18 174 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PI4K2BG5E9Z4 385 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 GYPCP04921 128 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 NUP85Q9BW27 656 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 IMPAD1Q9NX62 359 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 AKAP10O43572 662 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 RFC5P40937 340 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 UBE3AQ05086 875 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 SHCBP1Q8NEM2 672 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 CHD4Q14839 1912 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 MBD5Q9P267 1494 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 SAGE2PA6NJ88 616 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 LCA5LO95447 670 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 RAD9BQ6WBX8 426 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ZFYVE19Q96K21 471 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 HAO1Q9UJM8 370 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 NEO1Q92859 1461 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ARIH2O95376 493 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 RBBP7Q16576 425 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC34Q8IZ02 419 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 IL6P05231 212 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXC9P31274 260 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PRAMEP78395 509 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 CCNA1P78396 465 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP4A11Q02928 519 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT17Q04695 432 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 DDB1Q16531 1140 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 RUNDC3AQ59EK9 446 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 IRGCQ6NXR0 463 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 AADATQ8N5Z0 425 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 KCND1Q9NSA2 647 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 CES2O00748 559 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 TSPAN9O75954 239 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PSAPP07602 524 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PMF1Q6P1K2 205 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PALB2Q86YC2 1186 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PARD3BQ8TEW8 1205 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 OMA1Q96E52 524 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP6V1HQ9UI12 483 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 MAPRE3Q9UPY8 281 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 COPB2P35606 906 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 RAD23AP54725 363 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ANO4Q32M45 955 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 GRID1Q9ULK0 1009 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 EFR3BQ9Y2G0 817 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 STON1Q9Y6Q2 735 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 MED14O60244 1454 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 B2RBV5 119 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 CYTH3O43739 400 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 STX11O75558 287 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 USP1O94782 785 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 TTC27Q6P3X3 843 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 UNC45AQ9H3U1 944 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 CDK17Q00537 523 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 TTC23LQ6PF05 361 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 MICU2Q8IYU8 434 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 WHRNQ9P202 907 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 UBOX5O94941 541 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 AKAP5P24588 427 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 GSTA3Q16772 222 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 IZUMO2Q6UXV1 221 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms