RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 DNASE1L2Q92874 299 aa22.97■■□□□ 1.27
SOCS1-201ENST00000332029 CLDN23Q96B33 292 aa22.97■■□□□ 1.27
SOCS1-201ENST00000332029 RMDN1Q96DB5 314 aa22.97■■□□□ 1.27
SOCS1-201ENST00000332029 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.97■■□□□ 1.27
SOCS1-201ENST00000332029 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.97■■□□□ 1.27
SOCS1-201ENST00000332029 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.97■■□□□ 1.27
SOCS1-201ENST00000332029 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SOCS1-201ENST00000332029 MAFFQ9ULX9 164 aa22.97■■□□□ 1.27
SOCS1-201ENST00000332029 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.97■■□□□ 1.27
SOCS1-201ENST00000332029 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SOCS1-201ENST00000332029 CLIC4Q9Y696 253 aa22.97■■□□□ 1.27
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SOCS1-201ENST00000332029 CXCL8P10145 99 aa22.96■■□□□ 1.27
SOCS1-201ENST00000332029 LIG4P49917 911 aa22.96■■□□□ 1.27
SOCS1-201ENST00000332029 IQCEQ6IPM2 695 aa22.96■■□□□ 1.27
SOCS1-201ENST00000332029 DCLK2Q8N568 766 aa22.96■■□□□ 1.27
SOCS1-201ENST00000332029 BORCS6Q96GS4 357 aa22.96■■□□□ 1.27
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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SOCS1-201ENST00000332029 TBX20Q9UMR3 447 aa22.96■■□□□ 1.27
SOCS1-201ENST00000332029 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.96■■□□□ 1.27
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SOCS1-201ENST00000332029 TRAK2O60296 914 aa22.95■■□□□ 1.26
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SOCS1-201ENST00000332029 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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SOCS1-201ENST00000332029 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.95■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
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SOCS1-201ENST00000332029 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.95■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 BRD9Q9H8M2 597 aa22.95■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 CEP72Q9P209 647 aa22.95■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 GPR179Q6PRD1 2367 aa22.94■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 TTC26A0AVF1 554 aa22.94■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 SHISA7A6NL88 538 aa22.94■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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SOCS1-201ENST00000332029 SYT1P21579 422 aa22.94■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 DDIT3P35638 169 aa22.94■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 SPAG1Q07617 926 aa22.94■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 PTPAQ15257 358 aa22.94■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 KYAT1Q16773 422 aa22.94■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.94■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.94■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 LEMD2Q8NC56 503 aa22.94■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.94■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 KIF12Q96FN5 646 aa22.94■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 EPSTI1Q96J88 318 aa22.94■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 ASAH2Q9NR71 780 aa22.94■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 M0QZQ0 153 aa22.93■■□□□ 1.26
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SOCS1-201ENST00000332029 FZD5Q13467 585 aa22.93■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 USP49Q70CQ1 688 aa22.93■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 SMARCD2Q92925 531 aa22.93■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.93■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.93■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 PATJQ8NI35 1801 aa22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 LACTBL1A8MY62 500 aa22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 MAN2B1O00754 1011 aa22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 OGTO15294 1046 aa22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 OAZ2O95190 189 aa22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 GJA1P17302 382 aa22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 LRPAP1P30533 357 aa22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 EPHA5P54756 1037 aa22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 ZBTB6Q15916 424 aa22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 VITQ6UXI7 678 aa22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 BEST2Q8NFU1 509 aa22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 IRF7Q92985 503 aa22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 FIZ1Q96SL8 496 aa22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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SOCS1-201ENST00000332029 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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SOCS1-201ENST00000332029 YIPF1Q9Y548 306 aa22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 DNAH14Q0VDD8 3507 aa22.91■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 FAM189A1O60320 539 aa22.91■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 PSMC3P17980 439 aa22.91■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 CYP3A5P20815 502 aa22.91■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 GDI1P31150 447 aa22.91■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 ABCD1P33897 745 aa22.91■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 VIPR2P41587 438 aa22.91■■□□□ 1.26
SOCS1-201ENST00000332029 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
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