RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 LY75O60449 1722 aa26.79■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 DPPA5A6NC42 116 aa26.78■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 NCKAP1LP55160 1127 aa26.78■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa26.78■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 ARMC2Q8NEN0 867 aa26.78■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 BSNDQ8WZ55 320 aa26.78■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 VPS37BQ9H9H4 285 aa26.78■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 ZFATQ9P243 1243 aa26.78■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 MTM1Q13496 603 aa26.78■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.886e-6■■■■□ 25
SENP3-201ENST00000321337 PDK4Q16654 411 aa26.78■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 DACT2Q5SW24 774 aa26.78■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 ZNF516Q92618 1163 aa26.78■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 HAUS1Q96CS2 278 aa26.78■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 SLC1A1P43005 524 aa26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 QARSP47897 775 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 NOP14P78316 857 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 SATB1Q01826 763 aa26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 GAD2Q05329 585 aa26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 NPHS2Q9NP85 383 aa26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 GOLGA8SH3BPF8 625 aa26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 GOLGA8MH3BSY2 632 aa26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 PSMC4P43686 418 aa26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 WNT7BP56706 349 aa26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 MAPK6Q16659 721 aa26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 MON1BQ7L1V2 547 aa26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 LRRC8CQ8TDW0 803 aa26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 MIPEPQ99797 713 aa26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SENP3-201ENST00000321337 DENND3A2RUS2 1198 aa26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.872e-6■■■■□ 20.7
SENP3-201ENST00000321337 ABHD2P08910 425 aa26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 NSFP46459 744 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 NPTX2P47972 431 aa26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 OVGP1Q12889 678 aa26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 CFAP57Q96MR6 1250 aa26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 NFIBO00712 420 aa26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 POTEJP0CG39 1038 aa26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 CYP24A1Q07973 514 aa26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 ANKMY2Q8IV38 441 aa26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 RHOT1Q8IXI2 618 aa26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 UBN1Q9NPG3 1134 aa26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 KANSL3Q9P2N6 904 aa26.76■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 LVRNQ6Q4G3 990 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 CCDC125Q86Z20 511 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 ZBED8Q8IZ13 594 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 SPIRE2Q8WWL2 714 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 SMC6Q96SB8 1091 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 DCTN4Q9UJW0 460 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 SLX4Q8IY92 1834 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 SPDYE5A6NIY4 337 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 TYROBPO43914 113 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 ARSEP51690 589 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 GPS1Q13098 491 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 MAMLD1Q13495 774 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 XKR9Q5GH70 373 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 BBOF1Q8ND07 529 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 INPP5DQ92835 1189 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 MFSD14AQ96MC6 490 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 EHMT1Q9H9B1 1298 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 CYLDQ9NQC7 956 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 SCN9AQ15858 1988 aa26.75■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 LIASO43766 372 aa26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 ATP4AP20648 1035 aa26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 PCK1P35558 622 aa26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 NLRP9Q7RTR0 991 aa26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 RFWD2Q8NHY2 731 aa26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 ASAP3Q8TDY4 903 aa26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 C10orf88Q9H8K7 445 aa26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 ZNF148Q9UQR1 794 aa26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 TMX2Q9Y320 296 aa26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 ATP5HO75947 161 aa26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 SESN3P58005 492 aa26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 SCARA3Q6AZY7 606 aa26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 FAM213AQ9BRX8 229 aa26.74■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 ATP9AO75110 1047 aa26.73■■□□□ 1.87
SENP3-201ENST00000321337 DCTN3O75935 186 aa26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms