RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 ZNF862O60290 1169 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 KCNA2P16389 499 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 GNAZP19086 355 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 TMEM62Q0P6H9 643 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 ZDHHC24Q6UX98 284 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 UCMAQ8WVF2 138 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 TLCD1Q96CP7 247 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 DENND3A2RUS2 1198 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 CTNNA2P26232 953 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 DSG3P32926 999 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 OAZ1P54368 228 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 DRG2P55039 364 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 SOX10P56693 466 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 COPS2P61201 443 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 ANKRD23Q86SG2 305 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 LMNTD2Q8IXW0 634 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 HELQQ8TDG4 1101 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 C12orf42Q96LP6 360 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 KMT5AQ9NQR1 393 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 RGS20O76081 388 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 HSPA6P17066 643 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 GALNTL6Q49A17 601 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 TTC27Q6P3X3 843 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 CEP170P1Q96L14 293 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 LCTP09848 1927 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 FZD9O00144 591 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 CHRNA3P32297 505 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 RAD23BP54727 409 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 MFAP3P55082 362 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 MYBPC3Q14896 1274 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 KRT39Q6A163 491 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 KIFAP3Q92845 792 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 CENPTQ96BT3 561 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 GRHL1Q9NZI5 618 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 PCYOX1Q9UHG3 505 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 TLDC2A0PJX2 215 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 CYP1A2P05177 515 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 GPC3P51654 580 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 MAIP1Q8WWC4 291 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 MAFGO15525 162 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 STBD1O95210 358 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 PYGMP11217 842 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 BNIP1Q12981 228 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 LBRQ14739 615 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 MORC4Q8TE76 937 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 CYP11B1P15538 503 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 ATP6V1C1P21283 382 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 ABCD1P33897 745 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 KCNJ1P48048 391 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 SP4Q02446 784 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 FBXL18Q96ME1 805 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 SNX3O60493 162 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 KLC1Q07866 573 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 OR52E8Q6IFG1 317 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 NUP85Q9BW27 656 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 CYP39A1Q9NYL5 469 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 RASAL2Q9UJF2 1139 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 GGPS1O95749 300 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 PSAPP07602 524 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 NUDT17P0C025 328 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 SETSIPP0DME0 302 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 RPL21P46778 160 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 SWSAP1Q6NVH7 229 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS6-201ENST00000299238 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms