RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 RGL1Q9NZL6 768 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 CACNG4Q9UBN1 327 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHA12Q9UN75 941 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 GDAQ9Y2T3 454 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ASB3Q9Y575 518 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ARNTLO00327 626 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ACKR2O00590 384 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 CDKL5O76039 1030 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 APBB3O95704 486 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKCBP05771 671 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PYGBP11216 843 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP2B1P20020 1258 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 DRD1P21728 446 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 RARRES1P49788 294 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 EFNA5P52803 228 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 VEPH1Q14D04 833 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF12Q16514 161 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PLK5Q496M5 336 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 USP37Q86T82 979 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXL16Q8N461 479 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 IFT74Q96LB3 600 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSWIM3Q96MP5 696 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PDZD7Q9H5P4 517 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 BRMS1Q9HCU9 246 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXL5Q9UKA1 691 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PRU2 124 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF4O00268 1085 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PODXLO00592 558 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMTS3O15072 1205 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC37A4O43826 429 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 USO1O60763 962 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 SLITRK3O94933 977 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 LIG1P18858 919 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC25CP30307 473 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 MCM4P33991 863 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 NAMPTP43490 491 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 BRCC3P46736 316 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 SOX9P48436 509 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 MCM2P49736 904 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 NAB2Q15742 525 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 UAP1L1Q3KQV9 507 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 GLRA4Q5JXX5 417 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 NOSTRINQ8IVI9 506 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 GATA6Q92908 595 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 NOTCH4Q99466 2003 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 LNP1A1A4G5 178 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 EDIL3O43854 480 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 EXTL3O43909 919 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 GJA1P17302 382 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 WEE1P30291 646 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 CCR2P41597 374 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PXNP49023 591 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 DGKEP52429 567 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 BFSP1Q12934 665 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 NTRK3Q16288 839 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR158Q5T848 1215 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 MAEAQ7L5Y9 396 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 SYT13Q7L8C5 426 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC8Q8TAM2 541 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ERMNQ8TAM6 284 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TASP1Q9H6P5 420 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP72Q9P209 647 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 EBF1Q9UH73 591 aa8.61□□□□□ -1.03
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