RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 ARP10275 920 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 MTMR2Q13614 643 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CUL3Q13618 768 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 LAMB3Q13751 1172 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 RFWD3Q6PCD5 774 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 AGR3Q8TD06 166 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SLC26A7Q8TE54 656 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 ECM29Q5VYK3 1845 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 MEIS2O14770 477 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SOX10P56693 466 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 RHBDL3P58872 404 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PDIK1LQ8N165 341 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 DCLK3Q9C098 648 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PTPN4P29074 926 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 LMNB2Q03252 620 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CEP55Q53EZ4 464 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 OLFML3Q9NRN5 406 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 NMRK1Q9NWW6 199 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 NDE1Q9NXR1 346 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.189e-6■□□□□ 11.1
USP25-201ENST00000285679 TRPA1O75762 1119 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SPOPLQ6IQ16 392 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CETPP11597 493 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 WDR4P57081 412 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 COG7P83436 770 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 DNAJC24Q6P3W2 148 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 RFX6Q8HWS3 928 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SEL1LQ9UBV2 794 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 TJP3O95049 919 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 KRT19P08727 400 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 SAT1P21673 171 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 SLC1A5Q15758 541 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 SPDYCQ5MJ68 293 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 SCYL2Q6P3W7 929 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 DSTYKQ6XUX3 929 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 PTF1AQ7RTS3 328 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 TCP10LQ8TDR4 215 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 CEP170P1Q96L14 293 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 MANSC1Q9H8J5 431 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 KIAA1586Q9HCI6 787 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 ETAA1Q9NY74 926 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 DNPEPQ9ULA0 475 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 H7C0C1 242 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 COPEO14579 308 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 ZWINTO95229 277 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 ATP5OP48047 213 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 ACOT2P49753 483 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 OSTNP61366 133 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 NR1H3Q13133 447 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 TFDP1Q14186 410 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 MORC4Q8TE76 937 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 PI4KBQ9UBF8 816 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 CCPG1Q9ULG6 757 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 LRRIQ4A6NIV6 560 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 PIK3R2O00459 728 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 SERPINB2P05120 415 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 TPBGLP0DKB5 382 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 MYL2P10916 166 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 ATP6V1C1P21283 382 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 SHMT1P34896 483 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 KCNT1Q5JUK3 1230 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 ANO7Q6IWH7 933 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 IZUMO2Q6UXV1 221 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 RASSF3Q86WH2 238 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 NSL1Q96IY1 281 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 ACAP3Q96P50 834 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 VCX3BQ9H321 246 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 UNC45AQ9H3U1 944 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 VCX3AQ9NNX9 186 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 NRAPQ86VF7 1730 aa16.14■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 CHRNB2P17787 502 aa16.13■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 RNF43Q68DV7 783 aa16.13■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 ACAD10Q6JQN1 1059 aa16.13■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 CCNJLQ8IV13 435 aa16.13■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 HSPH1Q92598 858 aa16.13■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 PPP1R36Q96LQ0 422 aa16.13■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 BGNP21810 368 aa16.13■□□□□ 0.17
USP25-201ENST00000285679 GNA15P30679 374 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms