RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 SURF1Q15526 300 aa18.76■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 SCARA3Q6AZY7 606 aa18.76■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 EFCAB13Q8IY85 973 aa18.76■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 PPM1KQ8N3J5 372 aa18.76■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 KIF18AQ8NI77 898 aa18.76■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 C1orf112Q9NSG2 853 aa18.76■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 LRFN2Q9ULH4 789 aa18.76■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 NENFQ9UMX5 172 aa18.76■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 AP3M2P53677 418 aa18.75■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 SLC24A5Q71RS6 500 aa18.75■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.75■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 LINC01599Q8WXQ3 324 aa18.75■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 SHC3Q92529 594 aa18.75■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 FAM212AQ96EL1 285 aa18.75■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa18.75■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 TRIP11Q15643 1979 aa18.75■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 MYO9BQ13459 2157 aa18.75■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 MGEA5O60502 916 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 CLTAP09496 248 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 ANXA13P27216 316 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 MAGEA1P43355 309 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 MFAP3P55082 362 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC122Q5T0U0 273 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 FMNL3Q8IVF7 1028 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 MTMR12Q9C0I1 747 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 RGS18Q9NS28 235 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.593e-29■■□□□ 14.3
SRSF1-201ENST00000258962 PJA2O43164 708 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 KIF5CO60282 957 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 IL18RAPO95256 599 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 GCNT1Q02742 428 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 SPOPLQ6IQ16 392 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 NPAS4Q8IUM7 802 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 FAM71AQ8IYT1 594 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.593e-6■□□□□ 10.5
SRSF1-201ENST00000258962 CHST12Q9NRB3 414 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 GUCA1BQ9UMX6 200 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 DUSP10Q9Y6W6 482 aa18.74■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 NCOA4Q13772 614 aa18.73■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 DSC3Q14574 896 aa18.73■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF569Q5MCW4 686 aa18.73■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa18.73■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 SLC30A5Q8TAD4 765 aa18.73■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 TTC3P53804 2025 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 LCHNA4D1U4 455 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 LACTBL1A8MY62 500 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 C9IYK1 514 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 KRT86O43790 486 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 CST3P01034 146 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC172P0C7W6 258 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 TAP1Q03518 808 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 KIF5AQ12840 1032 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 GRIN2CQ14957 1233 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 KYAT1Q16773 422 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 DUOXA2Q1HG44 320 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 SLC10A6Q3KNW5 377 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 WDR44Q5JSH3 913 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 SLC35F6Q8N357 371 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 ARID3AQ99856 593 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 ADPGKQ9BRR6 497 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 TSGA10Q9BZW7 698 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 MYO1AQ9UBC5 1043 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 NAGPAQ9UK23 515 aa18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 PHACTR2O75167 634 aa18.71■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 NPTXRO95502 500 aa18.71■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 NFICP08651 508 aa18.71■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 CASQ1P31415 396 aa18.71■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 GRM5P41594 1212 aa18.71■□□□□ 0.59
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SRSF1-201ENST00000258962 SLC27A1Q6PCB7 646 aa18.71■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 SLC20A1Q8WUM9 679 aa18.71■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 NUB1Q9Y5A7 615 aa18.71■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 GBF1Q92538 1859 aa18.71■□□□□ 0.59
SRSF1-201ENST00000258962 LINC01553A4QN01 128 aa18.7■□□□□ 0.58
SRSF1-201ENST00000258962 CYP26A1O43174 497 aa18.7■□□□□ 0.58
SRSF1-201ENST00000258962 DGKIO75912 1065 aa18.7■□□□□ 0.58
SRSF1-201ENST00000258962 ASS1P00966 412 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM191BP0C7N4 346 aa18.7■□□□□ 0.58
SRSF1-201ENST00000258962 NOP14P78316 857 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SRSF1-201ENST00000258962 FAM189BP81408 668 aa18.7■□□□□ 0.58
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