RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000198767.10

RRN3-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRN3, Length 3,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-201ENST00000198767 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 TGFB1I1O43294 461 aa9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 GJB6O95452 261 aa9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 SFNP31947 248 aa9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 CALCOCO2Q13137 446 aa9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 USP37Q86T82 979 aa9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 ARHGEF19Q8IW93 802 aa9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 SYCE1Q8N0S2 351 aa9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 HERPUD2Q9BSE4 406 aa9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 RRAGCQ9HB90 399 aa9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 GGA2Q9UJY4 613 aa9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa9.34□□□□□ -0.91
RRN3-201ENST00000198767 CYP26A1O43174 497 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 GHRP10912 638 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 GNAT1P11488 350 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 RFC5P40937 340 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 PIK3CAP42336 1068 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 CPA2P48052 419 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 HSD17B4P51659 736 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 ZNF131P52739 623 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 KRT17Q04695 432 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 BFSP1Q12934 665 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 TRPC3Q13507 836 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 ANO5Q75V66 913 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.34□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 SGPL1O95470 568 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 ADCY8P40145 1251 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 PTGIRP43119 386 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 EMC2Q15006 297 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 FAM47CQ5HY64 1035 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 KAZNQ674X7 775 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 RFWD3Q6PCD5 774 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 SESTD1Q86VW0 696 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 RASGEF1CQ8N431 466 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 PDGFCQ9NRA1 345 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 LY75O60449 1722 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 ASAP2O43150 1006 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 ZNF862O60290 1169 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 CLCN3P51790 818 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 IWS1Q96ST2 819 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 SYNCQ9H7C4 482 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 CYP26B1Q9NR63 512 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 HOMER3Q9NSC5 361 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 KLHL14Q9P2G3 628 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 FBXO40Q9UH90 709 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 SEL1L2Q5TEA6 688 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 AP1ARQ63HQ0 302 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 NT5C1BQ96P26 610 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 PCDHB18PQ96TA0 734 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 SYT15Q9BQS2 421 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 SEL1LQ9UBV2 794 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 CPA4Q9UI42 421 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 AGTP01019 485 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 ITGA8P53708 1063 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 HUNKP57058 714 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 ADCY2Q08462 1091 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 SGO2Q562F6 1265 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 XKR3Q5GH77 459 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 SLFN11Q7Z7L1 901 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 RNF169Q8NCN4 708 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 PORCNQ9H237 461 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 TBX20Q9UMR3 447 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 RASA4BC9J798 803 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 PI4K2BG5E9Z4 385 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 RASA4O43374 803 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 PHF2O75151 1096 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-201ENST00000198767 ETS1P14921 441 aa9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms