RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm3739L7N296 216 aa13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sppl2bQ3TD49 578 aa13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zbtb17Q60821 794 aa13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sin3bQ62141 1098 aa13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gpc3Q8CFZ4 579 aa13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Il17cQ8K4C5 194 aa13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Socs4Q91ZA6 436 aa13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Map4k3Q99JP0 894 aa13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Micu3Q9CTY5 523 aa13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dph5Q9CWQ0 281 aa13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gtf2h1Q9DBA9 547 aa13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Scyl3Q9DBQ7 735 aa13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Krt17Q9QWL7 433 aa13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Irx4Q9QY61 515 aa13.9□□□□□ -0.18
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nup210lQ9D2F7 1881 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm4302E9PX25 294 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pitpnm1O35954 1243 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 NsfP46460 744 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AdkP55264 361 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Znf367Q0VDT2 340 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trip13Q3UA06 432 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 SpdyaQ5IBH7 310 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Irak1Q62406 710 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Frmd5Q6P5H6 517 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q6PD19 689 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PrcpQ7TMR0 491 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr670Q7TRP3 312 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tspan18Q80WR1 248 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mical2Q8BML1 960 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trpv6Q91WD2 767 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sar1bQ9CQC9 198 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mis12Q9CY25 206 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gstt4Q9D4P7 240 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PirQ9D711 290 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 B4galt4Q9JJ04 344 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pdzd4Q9QY39 772 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm2030D3Z7C4 212 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm8994E9PV04 411 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trim30bE9PVL6 203 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PltpP55065 493 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pcsk1P63239 753 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ppp4r3cQ3V0Y1 813 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cct6bQ61390 531 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 R3hdm2Q80TM6 1044 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PolrmtQ8BKF1 1207 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Wdr11Q8K1X1 1223 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mob2Q8VI63 235 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fuca1Q99LJ1 452 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cables1Q9ESJ1 568 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 ThegQ9JMB1 375 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Arid3bQ9Z1N7 568 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ttc17E9PVB5 1198 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sh3bp2Q06649 559 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gpc2Q8BKV1 579 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rftn2Q8CHX7 500 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam49bQ921M7 324 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 GhdcQ99J23 532 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cfap57Q9D180 1249 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 IdeQ9JHR7 1019 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rnf14Q9JI90 485 aa13.89□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Akap17bA2A3V1 959 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hsd17b14E9Q3D4 273 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nkx1-1G3UXB3 402 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cetn1P41209 172 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ndst1Q3UHN9 882 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CochQ62507 552 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ncoa7Q6DFV7 943 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mpp4Q6P7F1 635 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cfap100Q80VN0 613 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q8CD60 292 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gga1Q8R0H9 635 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 DarsQ922B2 501 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cnot8Q9D8X5 292 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Msl3Q9WVG9 525 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Scn1aA2APX8 2009 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Impa1O55023 277 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ppm1aP49443 382 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gpr15Q0VDU3 360 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kctd19Q562E2 927 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ttf2Q5NC05 1138 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cep112Q5PR68 954 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam43aQ8BUP8 424 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Uba3Q8C878 462 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ppfibp1Q8C8U0 969 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 FcrlaQ920A9 352 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 IscuQ9D7P6 168 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 DcpsQ9DAR7 338 aa13.88□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fcer2P20693 331 aa13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Plk1Q07832 603 aa13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ptcd3Q14C51 685 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nek10Q3UGM2 1111 aa13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc33Q3ULW6 985 aa13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tcp10aQ80W76 438 aa13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cdc23Q8BGZ4 597 aa13.87□□□□□ -0.19
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pcyox1Q9CQF9 505 aa13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.9 ms