RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kif9Q9WV04 790 aa6.99□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Speer4f2E9Q366 295 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl21O09167 160 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mt-CybP00158 381 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rag1P15919 1040 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CnpP16330 420 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pdha1P35486 390 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psmc4P54775 418 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NfiaQ02780 532 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Calb2Q08331 271 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gbp8Q2V6D6 525 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam8a1Q3URQ4 399 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Oog4Q4G0C7 502 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pabpn1lQ5XFR0 273 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sh3rf1Q69ZI1 892 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Orai3Q6P8G8 290 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spata24Q6P926 205 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnali1Q8BVN8 258 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Leg1Q8C6C9 337 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ugt3a2Q8JZZ0 523 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scrn2Q8VCA8 425 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ces1fQ91WU0 561 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hdac9Q99N13 588 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rsrc1Q9DBU6 334 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MipepA6H611 711 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grik3B1AS29 919 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tnfrsf18O35714 228 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp9aO70228 1047 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CidebO70303 219 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nptx2O70340 429 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mfsd14aP70187 490 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp11aP98197 1187 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdk16Q04735 496 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grm2Q14BI2 872 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FaxcQ3UMF9 409 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem65Q4VAE3 234 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Syce2Q505B8 171 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HarsQ61035 509 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Soat1Q61263 540 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hbs1lQ69ZS7 682 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MregQ6NVG5 214 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atg4cQ811C2 458 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Frmd4aQ8BIE6 1020 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gprasp2Q8BUY8 826 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pnma1Q8C1C8 353 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc80Q8R2G6 949 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd300ldQ8VCH2 221 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rin1Q921Q7 763 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptdss1Q99LH2 473 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrps22Q9CXW2 359 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bcs1lQ9CZP5 418 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Borcs6Q9D6W8 360 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dusp21Q9D9D8 189 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Subh2bvQ9D9Z7 123 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gabbr1Q9WV18 960 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IqccA2ADZ8 418 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EloblA6PWE0 161 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clrn2B2RVW2 232 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp4f40G3UW81 524 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Capn6O35646 641 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tlk2O55047 718 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl7aP12970 266 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 M6prP24668 278 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PdgfraP26618 1089 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gad2P48320 585 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 St3gal1P54751 337 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SbdsP70122 250 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Erbb2P70424 1256 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdca2Q14B71 982 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Luc7l3Q5SUF2 432 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdc14aQ6GQT0 603 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr101Q80T62 511 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CenpuQ8C4M7 410 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plekhg6Q8R0J1 787 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1499Q8VG65 314 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olr1Q9EQ09 363 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HemgnQ9ERZ0 503 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pdk2Q9JK42 407 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc22a3Q9WTW5 551 aa6.98□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mllt3A2AM29 569 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itpripl1A2ASA8 547 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptp4a2O70274 167 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HpdP49429 393 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hoxc13P50207 328 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Uchl4P58321 233 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Foxp2P58463 714 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppm1jQ149T7 507 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5168Q4KL04 211 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm13103Q4VAD2 491 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grm6Q5NCH9 871 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grb10Q60760 621 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpd2Q64521 727 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snx19Q6P4T1 997 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atl2Q6PA06 583 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ssxb5Q6XAS2 159 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tdpoz4Q6YCH2 370 aa6.97□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf139Q7TMV1 668 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.1 ms