RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeastyeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM10YOL093W TY1B-ER2Q03619 1755 aa7.41□□□□□ -1.22
TRM10YOL093W TY1B-MR1Q04214 1755 aa7.41□□□□□ -1.22
TRM10YOL093W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
TRM10YOL093W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
TRM10YOL093W TY1B-NL1Q12112 1755 aa7.41□□□□□ -1.22
TRM10YOL093W TY1B-GR1Q12141 1755 aa7.41□□□□□ -1.22
TRM10YOL093W TY1B-BLQ12490 1755 aa7.41□□□□□ -1.22
TRM10YOL093W MAM3Q12296 706 aa7.41□□□□□ -1.22
TRM10YOL093W TSC11P40061 1430 aa7.41□□□□□ -1.22
TRM10YOL093W TRM1P15565 570 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TRM10YOL093W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TRM10YOL093W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
TRM10YOL093W AI1P03875 834 aa7.39□□□□□ -1.23
TRM10YOL093W SBP1P10080 294 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRM10YOL093W VAC17P25591 423 aa7.38□□□□□ -1.23
TRM10YOL093W APP1P53933 587 aa7.38□□□□□ -1.23
TRM10YOL093W DNF1P32660 1571 aa7.37□□□□□ -1.23
TRM10YOL093W STH1P32597 1359 aa7.37□□□□□ -1.23
TRM10YOL093W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRM10YOL093W TAF7Q05021 590 aa7.37□□□□□ -1.23
TRM10YOL093W IES2P40154 320 aa7.36□□□□□ -1.23
TRM10YOL093W YPR053CQ6Q5F3 151 aa7.36□□□□□ -1.23
TRM10YOL093W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TRM10YOL093W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data7.35□□□□□ -1.23not detected
TRM10YOL093W MET5P47169 1442 aa7.35□□□□□ -1.23
TRM10YOL093W ULS1Q08562 1619 aa7.34□□□□□ -1.23
TRM10YOL093W ITT1Q04638 464 aa7.34□□□□□ -1.23
TRM10YOL093W CDC19P00549 500 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TRM10YOL093W SCJ1P25303 377 aa7.32□□□□□ -1.24
TRM10YOL093W NUP159P40477 1460 aa7.31□□□□□ -1.24
TRM10YOL093W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRM10YOL093W DSF2P38213 736 aa7.31□□□□□ -1.24
TRM10YOL093W EMW1P42842 904 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRM10YOL093W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRM10YOL093W NUP42P49686 430 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W CUZ1P53899 274 aa7.27□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W VPS15P22219 1454 aa7.26□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W SNT2P53127 1403 aa7.26□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W HST2P53686 357 aa7.25□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W DFG5Q05031 458 aa7.25□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W YRF1-1P0CX20 1796 aa7.25□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W YRF1-5P0CX21 1796 aa7.25□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W YRF1-8P0CX22 1796 aa7.25□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W SKN7P38889 622 aa7.24□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W CEM1P39525 442 aa7.24□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W IRC20Q06554 1556 aa7.24□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W LTE1P07866 1435 aa7.23□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W YBT1P32386 1661 aa7.22□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W MKS1P34072 584 aa7.22□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W TDA6Q06466 467 aa7.22□□□□□ -1.25
TRM10YOL093W SPO14P36126 1683 aa7.21□□□□□ -1.26
TRM10YOL093W PDR12Q02785 1511 aa7.21□□□□□ -1.26
TRM10YOL093W SBE2P42223 864 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TRM10YOL093W YMR187CQ03236 431 aa7.2□□□□□ -1.26
TRM10YOL093W MMP1Q12372 583 aa7.2□□□□□ -1.26
TRM10YOL093W GDB1Q06625 1536 aa7.2□□□□□ -1.26
TRM10YOL093W CAT8P39113 1433 aa7.19□□□□□ -1.26
TRM10YOL093W VTC4P47075 721 aa7.18□□□□□ -1.26
TRM10YOL093W ADE12P80210 433 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRM10YOL093W NUP170P38181 1502 aa7.17□□□□□ -1.26
TRM10YOL093W BDS1Q08347 646 aa7.17□□□□□ -1.26
TRM10YOL093W BUD3P25558 1636 aa7.16□□□□□ -1.26
TRM10YOL093W DIT2P21595 489 aa7.16□□□□□ -1.26
TRM10YOL093W TY3B-GQ99315 1547 aa7.15□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W ESS1P22696 170 aa7.14□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W DOP1Q03921 1698 aa7.13□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W PDR10P51533 1564 aa7.13□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W MET10P39692 1035 aa7.13□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W DRS2P39524 1355 aa7.12□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W GLN1P32288 370 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W SYT1Q06836 1226 aa7.12□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W IQG1Q12280 1495 aa7.11□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W TRM3Q07527 1436 aa7.11□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W YJU3P28321 313 aa7.11□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W FBP26P32604 452 aa7.1□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TRM10YOL093W YNR014WP53719 212 aa7.08□□□□□ -1.28
TRM10YOL093W STE6P12866 1290 aa7.07□□□□□ -1.28
TRM10YOL093W DIT1P21623 536 aa7.07□□□□□ -1.28
TRM10YOL093W DAL1P32375 460 aa7.07□□□□□ -1.28
TRM10YOL093W FIG4P42837 879 aa7.07□□□□□ -1.28
TRM10YOL093W YCK2P23292 546 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TRM10YOL093W RSC30P38781 883 aa7.06□□□□□ -1.28
TRM10YOL093W LEU3P08638 886 aa7.05□□□□□ -1.28
TRM10YOL093W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TRM10YOL093W SRB8P25648 1427 aa7.04□□□□□ -1.28
TRM10YOL093W ATF2P53296 535 aa7.04□□□□□ -1.28
TRM10YOL093W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
TRM10YOL093W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa7.03□□□□□ -1.28
TRM10YOL093W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
TRM10YOL093W MMS1Q06211 1407 aa7.01□□□□□ -1.29
TRM10YOL093W BNI1P41832 1953 aa7.01□□□□□ -1.29
TRM10YOL093W UBP15P50101 1230 aa7.01□□□□□ -1.29
TRM10YOL093W YDR215CQ12240 137 aa7.01□□□□□ -1.29
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