RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639850.1

ME2-216, Transcript of malic enzyme 2, human

TSL 5 BASIC

Gene ME2, Length 2,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ME2-216	ENST00000639850	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ME2-216	ENST00000639850	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
ME2-216	ENST00000639850	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ME2-216	ENST00000639850	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
ME2-216	ENST00000639850	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		28	■■■□□ 2.07
ME2-216	ENST00000639850	NOS1	P29475	1434 aa		28	■■■□□ 2.07
ME2-216	ENST00000639850	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
ME2-216	ENST00000639850	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		27.99	■■■□□ 2.07
ME2-216	ENST00000639850	RALBP1	Q15311	655 aa		27.99	■■■□□ 2.07
ME2-216	ENST00000639850	PPL	O60437	1756 aa		27.99	■■■□□ 2.07
ME2-216	ENST00000639850	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ME2-216	ENST00000639850	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
ME2-216	ENST00000639850	PIK3C2B	O00750	1634 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ME2-216	ENST00000639850	SYNM	O15061	1565 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ME2-216	ENST00000639850	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
ME2-216	ENST00000639850	TMC1	Q8TDI8	760 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ME2-216	ENST00000639850	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ME2-216	ENST00000639850	PANK3	Q9H999	370 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ME2-216	ENST00000639850	CDCA8	Q53HL2	280 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ME2-216	ENST00000639850	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ME2-216	ENST00000639850	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
ME2-216	ENST00000639850	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ME2-216	ENST00000639850	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		27.89	■■■□□ 2.05
ME2-216	ENST00000639850	PIK3C2G	O75747	1445 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ME2-216	ENST00000639850	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ME2-216	ENST00000639850	RERE	Q9P2R6	1566 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ME2-216	ENST00000639850	NEFL	P07196	543 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ME2-216	ENST00000639850	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ME2-216	ENST00000639850	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ME2-216	ENST00000639850	SLC24A1	O60721	1099 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ME2-216	ENST00000639850	FKBP8	Q14318	412 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ME2-216	ENST00000639850	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ME2-216	ENST00000639850	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
ME2-216	ENST00000639850	IDI1	Q13907	227 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ME2-216	ENST00000639850	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ME2-216	ENST00000639850	AGL	P35573	1532 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ME2-216	ENST00000639850	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
ME2-216	ENST00000639850	NLRP13	Q86W25	1043 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ME2-216	ENST00000639850	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ME2-216	ENST00000639850	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ME2-216	ENST00000639850	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
ME2-216	ENST00000639850	MYOM1	P52179	1685 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ME2-216	ENST00000639850	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ME2-216	ENST00000639850	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ME2-216	ENST00000639850	ERVK-7	P63135	1459 aa		27.76	■■■□□ 2.04
ME2-216	ENST00000639850	ADGRB1	O14514	1584 aa		27.76	■■■□□ 2.04
ME2-216	ENST00000639850	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		27.76	■■■□□ 2.03
ME2-216	ENST00000639850	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
ME2-216	ENST00000639850	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
ME2-216	ENST00000639850	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ME2-216	ENST00000639850	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
ME2-216	ENST00000639850	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ME2-216	ENST00000639850	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ME2-216	ENST00000639850	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
ME2-216	ENST00000639850	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
ME2-216	ENST00000639850	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ME2-216	ENST00000639850	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ME2-216	ENST00000639850	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ME2-216	ENST00000639850	ZFYVE9	O95405	1425 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ME2-216	ENST00000639850	BCAN	Q96GW7	911 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ME2-216	ENST00000639850	MLEC	Q14165	292 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ME2-216	ENST00000639850	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
ME2-216	ENST00000639850	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		27.67	■■■□□ 2.02
ME2-216	ENST00000639850	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
ME2-216	ENST00000639850	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
ME2-216	ENST00000639850	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ME2-216	ENST00000639850	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ME2-216	ENST00000639850	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ME2-216	ENST00000639850	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
ME2-216	ENST00000639850	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ME2-216	ENST00000639850	PPP2R1A	P30153	589 aa		27.57	■■■□□ 2
ME2-216	ENST00000639850	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
ME2-216	ENST00000639850	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
ME2-216	ENST00000639850	NUDC	Q9Y266	331 aa		27.55	■■■□□ 2
ME2-216	ENST00000639850	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		27.53	■■■□□ 2
ME2-216	ENST00000639850	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
ME2-216	ENST00000639850	INSR	P06213	1382 aa		27.52	■■■□□ 2
ME2-216	ENST00000639850	EVC2	Q86UK5	1308 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ME2-216	ENST00000639850	STK26	Q9P289	416 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ME2-216	ENST00000639850	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ME2-216	ENST00000639850	ZMYM3	Q14202	1370 aa		27.48	■■□□□ 1.99
ME2-216	ENST00000639850	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
ME2-216	ENST00000639850	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
ME2-216	ENST00000639850	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		27.47	■■□□□ 1.99
ME2-216	ENST00000639850	ALK	Q9UM73	1620 aa		27.47	■■□□□ 1.99
ME2-216	ENST00000639850	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		27.47	■■□□□ 1.99
ME2-216	ENST00000639850	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	27.45	■■□□□ 1.98
ME2-216	ENST00000639850	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	27.45	■■□□□ 1.98
ME2-216	ENST00000639850	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		27.45	■■□□□ 1.98
ME2-216	ENST00000639850	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	27.44	■■□□□ 1.98
ME2-216	ENST00000639850	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		27.43	■■□□□ 1.98
ME2-216	ENST00000639850	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		27.42	■■□□□ 1.98
ME2-216	ENST00000639850	PTPRM	P28827	1452 aa		27.42	■■□□□ 1.98
ME2-216	ENST00000639850	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	27.42	■■□□□ 1.98
ME2-216	ENST00000639850	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		27.42	■■□□□ 1.98
ME2-216	ENST00000639850	PDE3B	Q13370	1112 aa		27.39	■■□□□ 1.97
ME2-216	ENST00000639850	CABP2	Q9NPB3	220 aa		27.39	■■□□□ 1.97
ME2-216	ENST00000639850	POGK	Q9P215	609 aa		27.39	■■□□□ 1.97
ME2-216	ENST00000639850	PRAM1	Q96QH2	718 aa		27.38	■■□□□ 1.97
ME2-216	ENST00000639850	USP32	Q8NFA0	1604 aa		27.36	■■□□□ 1.97

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