RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
PMS1-222ENST00000639501 USP19O94966 1318 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA2Q08379 1002 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-222ENST00000639501 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PMS1-222ENST00000639501 PPP2R1AP30153 589 aa26.61■■□□□ 1.85
PMS1-222ENST00000639501 TMF1P82094 1093 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-222ENST00000639501 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-222ENST00000639501 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
PMS1-222ENST00000639501 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PMS1-222ENST00000639501 POGKQ9P215 609 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-222ENST00000639501 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.58■■□□□ 1.85
PMS1-222ENST00000639501 ASXL2Q76L83 1435 aa26.58■■□□□ 1.85
PMS1-222ENST00000639501 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-222ENST00000639501 SLFN5Q08AF3 891 aa26.57■■□□□ 1.84
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PMS1-222ENST00000639501 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-222ENST00000639501 PREX2Q70Z35 1606 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-222ENST00000639501 BCAR3O75815 825 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-222ENST00000639501 SEC24BO95487 1268 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-222ENST00000639501 IGHDP01880 384 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-222ENST00000639501 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.55■■□□□ 1.84
PMS1-222ENST00000639501 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PMS1-222ENST00000639501 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PMS1-222ENST00000639501 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PMS1-222ENST00000639501 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.52■■□□□ 1.84
PMS1-222ENST00000639501 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.834e-6■■□□□ 13.1
PMS1-222ENST00000639501 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PMS1-222ENST00000639501 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.51■■□□□ 1.83
PMS1-222ENST00000639501 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PMS1-222ENST00000639501 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.5■■□□□ 1.83
PMS1-222ENST00000639501 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.49■■□□□ 1.83
PMS1-222ENST00000639501 UNC13BO14795 1591 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-222ENST00000639501 NLRP1Q9C000 1473 aa26.48■■□□□ 1.83
PMS1-222ENST00000639501 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PMS1-222ENST00000639501 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PMS1-222ENST00000639501 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.47■■□□□ 1.83
PMS1-222ENST00000639501 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.46■■□□□ 1.83
PMS1-222ENST00000639501 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
PMS1-222ENST00000639501 APAF1O14727 1248 aa26.44■■□□□ 1.82
PMS1-222ENST00000639501 PLCH2O75038 1416 aa26.43■■□□□ 1.82
PMS1-222ENST00000639501 PIK3C2GO75747 1445 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-222ENST00000639501 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.41■■□□□ 1.82
PMS1-222ENST00000639501 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-222ENST00000639501 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-222ENST00000639501 SYNMO15061 1565 aa26.39■■□□□ 1.82
PMS1-222ENST00000639501 IQGAP1P46940 1657 aa26.39■■□□□ 1.81
PMS1-222ENST00000639501 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.39■■□□□ 1.81
PMS1-222ENST00000639501 MYOM1P52179 1685 aa26.38■■□□□ 1.81
PMS1-222ENST00000639501 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.38■■□□□ 1.81
PMS1-222ENST00000639501 PANK1Q8TE04 598 aa26.37■■□□□ 1.81
PMS1-222ENST00000639501 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.36■■□□□ 1.81
PMS1-222ENST00000639501 COG6Q9Y2V7 657 aa26.36■■□□□ 1.81
PMS1-222ENST00000639501 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.35■■□□□ 1.81
PMS1-222ENST00000639501 MADDQ8WXG6 1647 aa26.34■■□□□ 1.81
PMS1-222ENST00000639501 BECN1Q14457 450 aa26.34■■□□□ 1.81
PMS1-222ENST00000639501 ARXQ96QS3 562 aa26.34■■□□□ 1.81
PMS1-222ENST00000639501 E9PSI1 815 aa26.33■■□□□ 1.81
PMS1-222ENST00000639501 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.33■■□□□ 1.81
PMS1-222ENST00000639501 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.33■■□□□ 1.8
PMS1-222ENST00000639501 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.31■■□□□ 1.8
PMS1-222ENST00000639501 ATP10AO60312 1499 aa26.31■■□□□ 1.8
PMS1-222ENST00000639501 PDE3AQ14432 1141 aa26.29■■□□□ 1.8
PMS1-222ENST00000639501 FANCAO15360 1455 aa26.29■■□□□ 1.8
PMS1-222ENST00000639501 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.29■■□□□ 1.8
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.28■■□□□ 1.8
PMS1-222ENST00000639501 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
PMS1-222ENST00000639501 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
PMS1-222ENST00000639501 PLXNC1O60486 1568 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-222ENST00000639501 CD109Q6YHK3 1445 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-222ENST00000639501 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PMS1-222ENST00000639501 ABCC1P33527 1531 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-222ENST00000639501 TNNQ9UQP3 1299 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-222ENST00000639501 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-222ENST00000639501 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-222ENST00000639501 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PMS1-222ENST00000639501 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
PMS1-222ENST00000639501 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-222ENST00000639501 PANK2Q9BZ23 570 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-222ENST00000639501 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-222ENST00000639501 RLBP1P12271 317 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-222ENST00000639501 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.21■■□□□ 1.79
PMS1-222ENST00000639501 WWC1Q8IX03 1113 aa26.2■■□□□ 1.79
PMS1-222ENST00000639501 CDCA8Q53HL2 280 aa26.2■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.19■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 CEP152O94986 1710 aa26.19■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.19■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 FSD2A1L4K1 749 aa26.18■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.18■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 ADGRL1O94910 1474 aa26.18■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.16■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.15■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa26.15■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.15■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 DIP2BQ9P265 1576 aa26.15■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 AFAP1Q8N556 730 aa26.15■■□□□ 1.78
PMS1-222ENST00000639501 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms